Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV2

TRIM54, Tripartite motif-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM54Q9BYV2 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRIM54Q9BYV2 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRIM54Q9BYV2 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRIM54Q9BYV2 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRIM54Q9BYV2 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRIM54Q9BYV2 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRIM54Q9BYV2 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
TRIM54Q9BYV2 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRIM54Q9BYV2 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRIM54Q9BYV2 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRIM54Q9BYV2 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRIM54Q9BYV2 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRIM54Q9BYV2 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRIM54Q9BYV2 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRIM54Q9BYV2 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRIM54Q9BYV2 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRIM54Q9BYV2 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRIM54Q9BYV2 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRIM54Q9BYV2 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRIM54Q9BYV2 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRIM54Q9BYV2 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRIM54Q9BYV2 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRIM54Q9BYV2 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRIM54Q9BYV2 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRIM54Q9BYV2 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRIM54Q9BYV2 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRIM54Q9BYV2 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRIM54Q9BYV2 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRIM54Q9BYV2 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRIM54Q9BYV2 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRIM54Q9BYV2 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRIM54Q9BYV2 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRIM54Q9BYV2 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRIM54Q9BYV2 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRIM54Q9BYV2 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRIM54Q9BYV2 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRIM54Q9BYV2 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRIM54Q9BYV2 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRIM54Q9BYV2 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRIM54Q9BYV2 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRIM54Q9BYV2 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRIM54Q9BYV2 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
TRIM54Q9BYV2 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRIM54Q9BYV2 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRIM54Q9BYV2 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRIM54Q9BYV2 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRIM54Q9BYV2 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIM54Q9BYV2 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIM54Q9BYV2 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIM54Q9BYV2 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIM54Q9BYV2 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIM54Q9BYV2 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIM54Q9BYV2 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIM54Q9BYV2 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIM54Q9BYV2 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIM54Q9BYV2 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIM54Q9BYV2 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIM54Q9BYV2 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIM54Q9BYV2 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIM54Q9BYV2 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIM54Q9BYV2 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIM54Q9BYV2 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIM54Q9BYV2 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIM54Q9BYV2 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIM54Q9BYV2 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIM54Q9BYV2 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIM54Q9BYV2 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIM54Q9BYV2 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIM54Q9BYV2 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIM54Q9BYV2 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIM54Q9BYV2 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIM54Q9BYV2 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIM54Q9BYV2 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIM54Q9BYV2 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIM54Q9BYV2 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIM54Q9BYV2 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIM54Q9BYV2 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIM54Q9BYV2 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIM54Q9BYV2 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIM54Q9BYV2 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIM54Q9BYV2 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIM54Q9BYV2 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIM54Q9BYV2 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIM54Q9BYV2 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIM54Q9BYV2 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRIM54Q9BYV2 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRIM54Q9BYV2 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRIM54Q9BYV2 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRIM54Q9BYV2 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRIM54Q9BYV2 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRIM54Q9BYV2 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRIM54Q9BYV2 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRIM54Q9BYV2 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRIM54Q9BYV2 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRIM54Q9BYV2 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRIM54Q9BYV2 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRIM54Q9BYV2 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRIM54Q9BYV2 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRIM54Q9BYV2 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRIM54Q9BYV2 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms