Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY07

SLC4A5, Electrogenic sodium bicarbonate cotransporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A5Q9BY07 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC4A5Q9BY07 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC4A5Q9BY07 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC4A5Q9BY07 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC4A5Q9BY07 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC4A5Q9BY07 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC4A5Q9BY07 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC4A5Q9BY07 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC4A5Q9BY07 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC4A5Q9BY07 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC4A5Q9BY07 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC4A5Q9BY07 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC4A5Q9BY07 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC4A5Q9BY07 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC4A5Q9BY07 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC4A5Q9BY07 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC4A5Q9BY07 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC4A5Q9BY07 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC4A5Q9BY07 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC4A5Q9BY07 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC4A5Q9BY07 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC4A5Q9BY07 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC4A5Q9BY07 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC4A5Q9BY07 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC4A5Q9BY07 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC4A5Q9BY07 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC4A5Q9BY07 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC4A5Q9BY07 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC4A5Q9BY07 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC4A5Q9BY07 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC4A5Q9BY07 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC4A5Q9BY07 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC4A5Q9BY07 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC4A5Q9BY07 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC4A5Q9BY07 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC4A5Q9BY07 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC4A5Q9BY07 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC4A5Q9BY07 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC4A5Q9BY07 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC4A5Q9BY07 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC4A5Q9BY07 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC4A5Q9BY07 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC4A5Q9BY07 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC4A5Q9BY07 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC4A5Q9BY07 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC4A5Q9BY07 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC4A5Q9BY07 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC4A5Q9BY07 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC4A5Q9BY07 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC4A5Q9BY07 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC4A5Q9BY07 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC4A5Q9BY07 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC4A5Q9BY07 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC4A5Q9BY07 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC4A5Q9BY07 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC4A5Q9BY07 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC4A5Q9BY07 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC4A5Q9BY07 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC4A5Q9BY07 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC4A5Q9BY07 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC4A5Q9BY07 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC4A5Q9BY07 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC4A5Q9BY07 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC4A5Q9BY07 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC4A5Q9BY07 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC4A5Q9BY07 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC4A5Q9BY07 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC4A5Q9BY07 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC4A5Q9BY07 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC4A5Q9BY07 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC4A5Q9BY07 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC4A5Q9BY07 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC4A5Q9BY07 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC4A5Q9BY07 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC4A5Q9BY07 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC4A5Q9BY07 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC4A5Q9BY07 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC4A5Q9BY07 KRTAP4-4-201ENST00000390661 1081 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC4A5Q9BY07 GULP1-204ENST00000409637 1242 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC4A5Q9BY07 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC4A5Q9BY07 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC4A5Q9BY07 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC4A5Q9BY07 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC4A5Q9BY07 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC4A5Q9BY07 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC4A5Q9BY07 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC4A5Q9BY07 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC4A5Q9BY07 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC4A5Q9BY07 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC4A5Q9BY07 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC4A5Q9BY07 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC4A5Q9BY07 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC4A5Q9BY07 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC4A5Q9BY07 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC4A5Q9BY07 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC4A5Q9BY07 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC4A5Q9BY07 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC4A5Q9BY07 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC4A5Q9BY07 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC4A5Q9BY07 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.7 ms