Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW3

SNHG12, Putative uncharacterized protein SNHG12, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG12Q9BXW3 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
SNHG12Q9BXW3 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
SNHG12Q9BXW3 LGALSL-201ENST00000238875 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
SNHG12Q9BXW3 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
SNHG12Q9BXW3 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
SNHG12Q9BXW3 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
SNHG12Q9BXW3 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
SNHG12Q9BXW3 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
SNHG12Q9BXW3 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
SNHG12Q9BXW3 PCK2-216ENST00000561286 2012 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
SNHG12Q9BXW3 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
SNHG12Q9BXW3 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
SNHG12Q9BXW3 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
SNHG12Q9BXW3 BUB1B-PAK6-201ENST00000441369 2767 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
SNHG12Q9BXW3 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
SNHG12Q9BXW3 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
SNHG12Q9BXW3 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
SNHG12Q9BXW3 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
SNHG12Q9BXW3 NR3C1-201ENST00000231509 3556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
SNHG12Q9BXW3 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
SNHG12Q9BXW3 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
SNHG12Q9BXW3 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
SNHG12Q9BXW3 CEP131-201ENST00000269392 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
SNHG12Q9BXW3 OTP-201ENST00000306422 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
SNHG12Q9BXW3 SLC22A12-202ENST00000377567 2599 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
SNHG12Q9BXW3 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
SNHG12Q9BXW3 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.44
SNHG12Q9BXW3 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
SNHG12Q9BXW3 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
SNHG12Q9BXW3 SLC6A6P1-201ENST00000413933 1850 ntBASIC12.27□□□□□ -0.44
SNHG12Q9BXW3 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
SNHG12Q9BXW3 SLC4A7-213ENST00000454389 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
SNHG12Q9BXW3 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC12.27□□□□□ -0.44
SNHG12Q9BXW3 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.44
SNHG12Q9BXW3 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.44
SNHG12Q9BXW3 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
SNHG12Q9BXW3 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.44
SNHG12Q9BXW3 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
SNHG12Q9BXW3 RGMA-204ENST00000543599 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
SNHG12Q9BXW3 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
SNHG12Q9BXW3 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
SNHG12Q9BXW3 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.44
SNHG12Q9BXW3 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
SNHG12Q9BXW3 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
SNHG12Q9BXW3 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
SNHG12Q9BXW3 ADCY8-202ENST00000377928 3363 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
SNHG12Q9BXW3 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
SNHG12Q9BXW3 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.45
SNHG12Q9BXW3 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
SNHG12Q9BXW3 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
SNHG12Q9BXW3 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
SNHG12Q9BXW3 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
SNHG12Q9BXW3 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
SNHG12Q9BXW3 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
SNHG12Q9BXW3 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
SNHG12Q9BXW3 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
SNHG12Q9BXW3 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
SNHG12Q9BXW3 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC12.27□□□□□ -0.45
SNHG12Q9BXW3 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC12.27□□□□□ -0.45
SNHG12Q9BXW3 PCDHB5-201ENST00000231134 3408 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.45
SNHG12Q9BXW3 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
SNHG12Q9BXW3 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
SNHG12Q9BXW3 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
SNHG12Q9BXW3 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.45
SNHG12Q9BXW3 C8orf31-201ENST00000395172 1875 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
SNHG12Q9BXW3 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
SNHG12Q9BXW3 FAM156A-221ENST00000622447 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
SNHG12Q9BXW3 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
SNHG12Q9BXW3 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
SNHG12Q9BXW3 RPL15-213ENST00000611050 2363 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.27□□□□□ -0.45
SNHG12Q9BXW3 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
SNHG12Q9BXW3 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
SNHG12Q9BXW3 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
SNHG12Q9BXW3 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
SNHG12Q9BXW3 TMEM231-207ENST00000568377 2920 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
SNHG12Q9BXW3 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
SNHG12Q9BXW3 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
SNHG12Q9BXW3 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
SNHG12Q9BXW3 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
SNHG12Q9BXW3 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
SNHG12Q9BXW3 DNMT3B-204ENST00000353855 4237 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
SNHG12Q9BXW3 ARHGAP10-201ENST00000336498 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
SNHG12Q9BXW3 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
SNHG12Q9BXW3 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
SNHG12Q9BXW3 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
SNHG12Q9BXW3 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
SNHG12Q9BXW3 SLC4A7-207ENST00000437179 3667 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
SNHG12Q9BXW3 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
SNHG12Q9BXW3 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
SNHG12Q9BXW3 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
SNHG12Q9BXW3 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
SNHG12Q9BXW3 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
SNHG12Q9BXW3 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
SNHG12Q9BXW3 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
SNHG12Q9BXW3 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
SNHG12Q9BXW3 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
SNHG12Q9BXW3 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
SNHG12Q9BXW3 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
SNHG12Q9BXW3 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
SNHG12Q9BXW3 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms