Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXF6

RAB11FIP5, Rab11 family-interacting protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP5Q9BXF6 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB11FIP5Q9BXF6 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB11FIP5Q9BXF6 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB11FIP5Q9BXF6 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RAB11FIP5Q9BXF6 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RAB11FIP5Q9BXF6 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RAB11FIP5Q9BXF6 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RAB11FIP5Q9BXF6 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RAB11FIP5Q9BXF6 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RAB11FIP5Q9BXF6 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RAB11FIP5Q9BXF6 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RAB11FIP5Q9BXF6 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RAB11FIP5Q9BXF6 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RAB11FIP5Q9BXF6 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RAB11FIP5Q9BXF6 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RAB11FIP5Q9BXF6 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RAB11FIP5Q9BXF6 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RAB11FIP5Q9BXF6 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB11FIP5Q9BXF6 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB11FIP5Q9BXF6 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB11FIP5Q9BXF6 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB11FIP5Q9BXF6 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB11FIP5Q9BXF6 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB11FIP5Q9BXF6 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB11FIP5Q9BXF6 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB11FIP5Q9BXF6 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB11FIP5Q9BXF6 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB11FIP5Q9BXF6 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB11FIP5Q9BXF6 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB11FIP5Q9BXF6 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB11FIP5Q9BXF6 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB11FIP5Q9BXF6 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB11FIP5Q9BXF6 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB11FIP5Q9BXF6 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB11FIP5Q9BXF6 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB11FIP5Q9BXF6 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB11FIP5Q9BXF6 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB11FIP5Q9BXF6 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB11FIP5Q9BXF6 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB11FIP5Q9BXF6 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB11FIP5Q9BXF6 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB11FIP5Q9BXF6 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB11FIP5Q9BXF6 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB11FIP5Q9BXF6 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB11FIP5Q9BXF6 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB11FIP5Q9BXF6 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB11FIP5Q9BXF6 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB11FIP5Q9BXF6 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB11FIP5Q9BXF6 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB11FIP5Q9BXF6 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB11FIP5Q9BXF6 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB11FIP5Q9BXF6 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB11FIP5Q9BXF6 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB11FIP5Q9BXF6 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB11FIP5Q9BXF6 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB11FIP5Q9BXF6 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB11FIP5Q9BXF6 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB11FIP5Q9BXF6 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB11FIP5Q9BXF6 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB11FIP5Q9BXF6 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB11FIP5Q9BXF6 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB11FIP5Q9BXF6 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB11FIP5Q9BXF6 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB11FIP5Q9BXF6 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB11FIP5Q9BXF6 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB11FIP5Q9BXF6 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB11FIP5Q9BXF6 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB11FIP5Q9BXF6 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB11FIP5Q9BXF6 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB11FIP5Q9BXF6 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB11FIP5Q9BXF6 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB11FIP5Q9BXF6 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB11FIP5Q9BXF6 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB11FIP5Q9BXF6 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB11FIP5Q9BXF6 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB11FIP5Q9BXF6 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB11FIP5Q9BXF6 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB11FIP5Q9BXF6 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB11FIP5Q9BXF6 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB11FIP5Q9BXF6 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB11FIP5Q9BXF6 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB11FIP5Q9BXF6 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB11FIP5Q9BXF6 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB11FIP5Q9BXF6 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB11FIP5Q9BXF6 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB11FIP5Q9BXF6 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB11FIP5Q9BXF6 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB11FIP5Q9BXF6 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB11FIP5Q9BXF6 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB11FIP5Q9BXF6 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB11FIP5Q9BXF6 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB11FIP5Q9BXF6 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB11FIP5Q9BXF6 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB11FIP5Q9BXF6 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB11FIP5Q9BXF6 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB11FIP5Q9BXF6 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB11FIP5Q9BXF6 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB11FIP5Q9BXF6 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB11FIP5Q9BXF6 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB11FIP5Q9BXF6 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms