Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX63

BRIP1, Fanconi anemia group J protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRIP1Q9BX63 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
BRIP1Q9BX63 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
BRIP1Q9BX63 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
BRIP1Q9BX63 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
BRIP1Q9BX63 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
BRIP1Q9BX63 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
BRIP1Q9BX63 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
BRIP1Q9BX63 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
BRIP1Q9BX63 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
BRIP1Q9BX63 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
BRIP1Q9BX63 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
BRIP1Q9BX63 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
BRIP1Q9BX63 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
BRIP1Q9BX63 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
BRIP1Q9BX63 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
BRIP1Q9BX63 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
BRIP1Q9BX63 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
BRIP1Q9BX63 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
BRIP1Q9BX63 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
BRIP1Q9BX63 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
BRIP1Q9BX63 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
BRIP1Q9BX63 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
BRIP1Q9BX63 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
BRIP1Q9BX63 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
BRIP1Q9BX63 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
BRIP1Q9BX63 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
BRIP1Q9BX63 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
BRIP1Q9BX63 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
BRIP1Q9BX63 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
BRIP1Q9BX63 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
BRIP1Q9BX63 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
BRIP1Q9BX63 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
BRIP1Q9BX63 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
BRIP1Q9BX63 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
BRIP1Q9BX63 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
BRIP1Q9BX63 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
BRIP1Q9BX63 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
BRIP1Q9BX63 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
BRIP1Q9BX63 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
BRIP1Q9BX63 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
BRIP1Q9BX63 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
BRIP1Q9BX63 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
BRIP1Q9BX63 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
BRIP1Q9BX63 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
BRIP1Q9BX63 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
BRIP1Q9BX63 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
BRIP1Q9BX63 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
BRIP1Q9BX63 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
BRIP1Q9BX63 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
BRIP1Q9BX63 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
BRIP1Q9BX63 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
BRIP1Q9BX63 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
BRIP1Q9BX63 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
BRIP1Q9BX63 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
BRIP1Q9BX63 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
BRIP1Q9BX63 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
BRIP1Q9BX63 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
BRIP1Q9BX63 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
BRIP1Q9BX63 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
BRIP1Q9BX63 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
BRIP1Q9BX63 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
BRIP1Q9BX63 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
BRIP1Q9BX63 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
BRIP1Q9BX63 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
BRIP1Q9BX63 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
BRIP1Q9BX63 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
BRIP1Q9BX63 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
BRIP1Q9BX63 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
BRIP1Q9BX63 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
BRIP1Q9BX63 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
BRIP1Q9BX63 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
BRIP1Q9BX63 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
BRIP1Q9BX63 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
BRIP1Q9BX63 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
BRIP1Q9BX63 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
BRIP1Q9BX63 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
BRIP1Q9BX63 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
BRIP1Q9BX63 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
BRIP1Q9BX63 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
BRIP1Q9BX63 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
BRIP1Q9BX63 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
BRIP1Q9BX63 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
BRIP1Q9BX63 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
BRIP1Q9BX63 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
BRIP1Q9BX63 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
BRIP1Q9BX63 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
BRIP1Q9BX63 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
BRIP1Q9BX63 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
BRIP1Q9BX63 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
BRIP1Q9BX63 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
BRIP1Q9BX63 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
BRIP1Q9BX63 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
BRIP1Q9BX63 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
BRIP1Q9BX63 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
BRIP1Q9BX63 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
BRIP1Q9BX63 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
BRIP1Q9BX63 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
BRIP1Q9BX63 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
BRIP1Q9BX63 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
BRIP1Q9BX63 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.4 ms