Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVA0

KATNB1, Katanin p80 WD40 repeat-containing subunit B1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KATNB1Q9BVA0 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KATNB1Q9BVA0 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KATNB1Q9BVA0 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KATNB1Q9BVA0 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KATNB1Q9BVA0 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KATNB1Q9BVA0 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KATNB1Q9BVA0 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KATNB1Q9BVA0 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KATNB1Q9BVA0 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KATNB1Q9BVA0 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KATNB1Q9BVA0 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KATNB1Q9BVA0 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KATNB1Q9BVA0 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KATNB1Q9BVA0 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KATNB1Q9BVA0 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KATNB1Q9BVA0 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KATNB1Q9BVA0 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KATNB1Q9BVA0 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KATNB1Q9BVA0 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KATNB1Q9BVA0 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KATNB1Q9BVA0 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KATNB1Q9BVA0 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KATNB1Q9BVA0 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KATNB1Q9BVA0 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KATNB1Q9BVA0 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KATNB1Q9BVA0 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KATNB1Q9BVA0 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
KATNB1Q9BVA0 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KATNB1Q9BVA0 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KATNB1Q9BVA0 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
KATNB1Q9BVA0 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
KATNB1Q9BVA0 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KATNB1Q9BVA0 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KATNB1Q9BVA0 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KATNB1Q9BVA0 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KATNB1Q9BVA0 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
KATNB1Q9BVA0 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KATNB1Q9BVA0 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KATNB1Q9BVA0 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KATNB1Q9BVA0 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KATNB1Q9BVA0 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KATNB1Q9BVA0 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KATNB1Q9BVA0 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KATNB1Q9BVA0 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KATNB1Q9BVA0 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KATNB1Q9BVA0 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KATNB1Q9BVA0 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KATNB1Q9BVA0 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KATNB1Q9BVA0 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KATNB1Q9BVA0 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KATNB1Q9BVA0 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KATNB1Q9BVA0 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
KATNB1Q9BVA0 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
KATNB1Q9BVA0 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
KATNB1Q9BVA0 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
KATNB1Q9BVA0 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
KATNB1Q9BVA0 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
KATNB1Q9BVA0 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
KATNB1Q9BVA0 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
KATNB1Q9BVA0 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
KATNB1Q9BVA0 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
KATNB1Q9BVA0 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
KATNB1Q9BVA0 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
KATNB1Q9BVA0 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
KATNB1Q9BVA0 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
KATNB1Q9BVA0 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
KATNB1Q9BVA0 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
KATNB1Q9BVA0 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
KATNB1Q9BVA0 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
KATNB1Q9BVA0 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
KATNB1Q9BVA0 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
KATNB1Q9BVA0 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
KATNB1Q9BVA0 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
KATNB1Q9BVA0 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
KATNB1Q9BVA0 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
KATNB1Q9BVA0 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
KATNB1Q9BVA0 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
KATNB1Q9BVA0 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
KATNB1Q9BVA0 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
KATNB1Q9BVA0 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
KATNB1Q9BVA0 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
KATNB1Q9BVA0 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
KATNB1Q9BVA0 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
KATNB1Q9BVA0 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
KATNB1Q9BVA0 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
KATNB1Q9BVA0 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
KATNB1Q9BVA0 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
KATNB1Q9BVA0 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
KATNB1Q9BVA0 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
KATNB1Q9BVA0 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
KATNB1Q9BVA0 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
KATNB1Q9BVA0 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
KATNB1Q9BVA0 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
KATNB1Q9BVA0 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
KATNB1Q9BVA0 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
KATNB1Q9BVA0 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
KATNB1Q9BVA0 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
KATNB1Q9BVA0 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
KATNB1Q9BVA0 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
KATNB1Q9BVA0 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.1 ms