Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUZ4

TRAF4, TNF receptor-associated factor 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF4Q9BUZ4 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAF4Q9BUZ4 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAF4Q9BUZ4 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAF4Q9BUZ4 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAF4Q9BUZ4 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAF4Q9BUZ4 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAF4Q9BUZ4 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAF4Q9BUZ4 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAF4Q9BUZ4 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAF4Q9BUZ4 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAF4Q9BUZ4 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAF4Q9BUZ4 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAF4Q9BUZ4 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAF4Q9BUZ4 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAF4Q9BUZ4 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAF4Q9BUZ4 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAF4Q9BUZ4 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAF4Q9BUZ4 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAF4Q9BUZ4 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAF4Q9BUZ4 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAF4Q9BUZ4 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAF4Q9BUZ4 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAF4Q9BUZ4 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAF4Q9BUZ4 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAF4Q9BUZ4 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAF4Q9BUZ4 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAF4Q9BUZ4 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAF4Q9BUZ4 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAF4Q9BUZ4 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAF4Q9BUZ4 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAF4Q9BUZ4 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAF4Q9BUZ4 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAF4Q9BUZ4 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAF4Q9BUZ4 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAF4Q9BUZ4 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAF4Q9BUZ4 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAF4Q9BUZ4 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAF4Q9BUZ4 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAF4Q9BUZ4 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAF4Q9BUZ4 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAF4Q9BUZ4 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAF4Q9BUZ4 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAF4Q9BUZ4 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAF4Q9BUZ4 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAF4Q9BUZ4 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAF4Q9BUZ4 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAF4Q9BUZ4 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAF4Q9BUZ4 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAF4Q9BUZ4 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAF4Q9BUZ4 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAF4Q9BUZ4 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAF4Q9BUZ4 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAF4Q9BUZ4 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAF4Q9BUZ4 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAF4Q9BUZ4 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAF4Q9BUZ4 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAF4Q9BUZ4 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAF4Q9BUZ4 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAF4Q9BUZ4 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAF4Q9BUZ4 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAF4Q9BUZ4 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAF4Q9BUZ4 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAF4Q9BUZ4 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAF4Q9BUZ4 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAF4Q9BUZ4 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAF4Q9BUZ4 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAF4Q9BUZ4 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAF4Q9BUZ4 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAF4Q9BUZ4 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAF4Q9BUZ4 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAF4Q9BUZ4 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAF4Q9BUZ4 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAF4Q9BUZ4 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAF4Q9BUZ4 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAF4Q9BUZ4 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAF4Q9BUZ4 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAF4Q9BUZ4 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAF4Q9BUZ4 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAF4Q9BUZ4 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAF4Q9BUZ4 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAF4Q9BUZ4 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAF4Q9BUZ4 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAF4Q9BUZ4 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAF4Q9BUZ4 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAF4Q9BUZ4 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAF4Q9BUZ4 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAF4Q9BUZ4 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAF4Q9BUZ4 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAF4Q9BUZ4 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAF4Q9BUZ4 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAF4Q9BUZ4 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAF4Q9BUZ4 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAF4Q9BUZ4 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAF4Q9BUZ4 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAF4Q9BUZ4 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAF4Q9BUZ4 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAF4Q9BUZ4 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAF4Q9BUZ4 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAF4Q9BUZ4 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAF4Q9BUZ4 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms