Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUW7

C9orf16, UPF0184 protein C9orf16, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf16Q9BUW7 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C9orf16Q9BUW7 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C9orf16Q9BUW7 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C9orf16Q9BUW7 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C9orf16Q9BUW7 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C9orf16Q9BUW7 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C9orf16Q9BUW7 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C9orf16Q9BUW7 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C9orf16Q9BUW7 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C9orf16Q9BUW7 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C9orf16Q9BUW7 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C9orf16Q9BUW7 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C9orf16Q9BUW7 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C9orf16Q9BUW7 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C9orf16Q9BUW7 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C9orf16Q9BUW7 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C9orf16Q9BUW7 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
C9orf16Q9BUW7 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
C9orf16Q9BUW7 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
C9orf16Q9BUW7 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
C9orf16Q9BUW7 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
C9orf16Q9BUW7 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
C9orf16Q9BUW7 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
C9orf16Q9BUW7 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C9orf16Q9BUW7 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C9orf16Q9BUW7 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C9orf16Q9BUW7 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C9orf16Q9BUW7 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C9orf16Q9BUW7 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C9orf16Q9BUW7 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C9orf16Q9BUW7 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C9orf16Q9BUW7 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C9orf16Q9BUW7 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C9orf16Q9BUW7 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C9orf16Q9BUW7 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C9orf16Q9BUW7 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C9orf16Q9BUW7 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C9orf16Q9BUW7 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C9orf16Q9BUW7 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C9orf16Q9BUW7 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C9orf16Q9BUW7 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C9orf16Q9BUW7 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C9orf16Q9BUW7 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C9orf16Q9BUW7 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C9orf16Q9BUW7 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C9orf16Q9BUW7 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C9orf16Q9BUW7 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
C9orf16Q9BUW7 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C9orf16Q9BUW7 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C9orf16Q9BUW7 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C9orf16Q9BUW7 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C9orf16Q9BUW7 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C9orf16Q9BUW7 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C9orf16Q9BUW7 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C9orf16Q9BUW7 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
C9orf16Q9BUW7 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
C9orf16Q9BUW7 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C9orf16Q9BUW7 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C9orf16Q9BUW7 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C9orf16Q9BUW7 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C9orf16Q9BUW7 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C9orf16Q9BUW7 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C9orf16Q9BUW7 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C9orf16Q9BUW7 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C9orf16Q9BUW7 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C9orf16Q9BUW7 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C9orf16Q9BUW7 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C9orf16Q9BUW7 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C9orf16Q9BUW7 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C9orf16Q9BUW7 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
C9orf16Q9BUW7 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C9orf16Q9BUW7 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C9orf16Q9BUW7 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C9orf16Q9BUW7 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C9orf16Q9BUW7 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C9orf16Q9BUW7 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C9orf16Q9BUW7 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C9orf16Q9BUW7 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
C9orf16Q9BUW7 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
C9orf16Q9BUW7 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
C9orf16Q9BUW7 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C9orf16Q9BUW7 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C9orf16Q9BUW7 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C9orf16Q9BUW7 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C9orf16Q9BUW7 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
C9orf16Q9BUW7 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C9orf16Q9BUW7 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
C9orf16Q9BUW7 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C9orf16Q9BUW7 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C9orf16Q9BUW7 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C9orf16Q9BUW7 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C9orf16Q9BUW7 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
C9orf16Q9BUW7 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
C9orf16Q9BUW7 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC16■□□□□ 0.15
C9orf16Q9BUW7 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
C9orf16Q9BUW7 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
C9orf16Q9BUW7 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
C9orf16Q9BUW7 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
C9orf16Q9BUW7 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
C9orf16Q9BUW7 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms