Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSE4

HERPUD2, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD2Q9BSE4 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HERPUD2Q9BSE4 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HERPUD2Q9BSE4 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HERPUD2Q9BSE4 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HERPUD2Q9BSE4 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
HERPUD2Q9BSE4 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
HERPUD2Q9BSE4 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
HERPUD2Q9BSE4 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
HERPUD2Q9BSE4 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
HERPUD2Q9BSE4 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HERPUD2Q9BSE4 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HERPUD2Q9BSE4 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HERPUD2Q9BSE4 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HERPUD2Q9BSE4 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HERPUD2Q9BSE4 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HERPUD2Q9BSE4 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
HERPUD2Q9BSE4 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HERPUD2Q9BSE4 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HERPUD2Q9BSE4 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HERPUD2Q9BSE4 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HERPUD2Q9BSE4 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HERPUD2Q9BSE4 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HERPUD2Q9BSE4 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HERPUD2Q9BSE4 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HERPUD2Q9BSE4 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HERPUD2Q9BSE4 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HERPUD2Q9BSE4 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HERPUD2Q9BSE4 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HERPUD2Q9BSE4 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HERPUD2Q9BSE4 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HERPUD2Q9BSE4 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HERPUD2Q9BSE4 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
HERPUD2Q9BSE4 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HERPUD2Q9BSE4 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HERPUD2Q9BSE4 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HERPUD2Q9BSE4 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HERPUD2Q9BSE4 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HERPUD2Q9BSE4 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HERPUD2Q9BSE4 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HERPUD2Q9BSE4 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HERPUD2Q9BSE4 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HERPUD2Q9BSE4 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HERPUD2Q9BSE4 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HERPUD2Q9BSE4 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HERPUD2Q9BSE4 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HERPUD2Q9BSE4 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
HERPUD2Q9BSE4 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
HERPUD2Q9BSE4 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HERPUD2Q9BSE4 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
HERPUD2Q9BSE4 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HERPUD2Q9BSE4 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HERPUD2Q9BSE4 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HERPUD2Q9BSE4 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HERPUD2Q9BSE4 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HERPUD2Q9BSE4 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HERPUD2Q9BSE4 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HERPUD2Q9BSE4 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HERPUD2Q9BSE4 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HERPUD2Q9BSE4 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HERPUD2Q9BSE4 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HERPUD2Q9BSE4 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HERPUD2Q9BSE4 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HERPUD2Q9BSE4 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HERPUD2Q9BSE4 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HERPUD2Q9BSE4 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HERPUD2Q9BSE4 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HERPUD2Q9BSE4 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HERPUD2Q9BSE4 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HERPUD2Q9BSE4 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HERPUD2Q9BSE4 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HERPUD2Q9BSE4 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HERPUD2Q9BSE4 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HERPUD2Q9BSE4 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HERPUD2Q9BSE4 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
HERPUD2Q9BSE4 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HERPUD2Q9BSE4 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HERPUD2Q9BSE4 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HERPUD2Q9BSE4 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HERPUD2Q9BSE4 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HERPUD2Q9BSE4 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HERPUD2Q9BSE4 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HERPUD2Q9BSE4 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HERPUD2Q9BSE4 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HERPUD2Q9BSE4 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HERPUD2Q9BSE4 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
HERPUD2Q9BSE4 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HERPUD2Q9BSE4 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HERPUD2Q9BSE4 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HERPUD2Q9BSE4 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HERPUD2Q9BSE4 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HERPUD2Q9BSE4 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HERPUD2Q9BSE4 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HERPUD2Q9BSE4 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
HERPUD2Q9BSE4 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HERPUD2Q9BSE4 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HERPUD2Q9BSE4 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HERPUD2Q9BSE4 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HERPUD2Q9BSE4 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HERPUD2Q9BSE4 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HERPUD2Q9BSE4 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms