Protein–RNA interactions for Protein: Q99708

RBBP8, DNA endonuclease RBBP8, humanhuman

Predictions only

Length 897 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP8Q99708 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
RBBP8Q99708 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RBBP8Q99708 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RBBP8Q99708 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RBBP8Q99708 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RBBP8Q99708 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RBBP8Q99708 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RBBP8Q99708 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RBBP8Q99708 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
RBBP8Q99708 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RBBP8Q99708 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
RBBP8Q99708 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RBBP8Q99708 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
RBBP8Q99708 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
RBBP8Q99708 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RBBP8Q99708 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
RBBP8Q99708 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RBBP8Q99708 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RBBP8Q99708 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
RBBP8Q99708 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RBBP8Q99708 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RBBP8Q99708 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RBBP8Q99708 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RBBP8Q99708 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RBBP8Q99708 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
RBBP8Q99708 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RBBP8Q99708 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RBBP8Q99708 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RBBP8Q99708 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RBBP8Q99708 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RBBP8Q99708 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RBBP8Q99708 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RBBP8Q99708 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RBBP8Q99708 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RBBP8Q99708 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RBBP8Q99708 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RBBP8Q99708 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RBBP8Q99708 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RBBP8Q99708 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RBBP8Q99708 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RBBP8Q99708 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RBBP8Q99708 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RBBP8Q99708 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RBBP8Q99708 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
RBBP8Q99708 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RBBP8Q99708 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RBBP8Q99708 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RBBP8Q99708 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RBBP8Q99708 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RBBP8Q99708 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RBBP8Q99708 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RBBP8Q99708 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RBBP8Q99708 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RBBP8Q99708 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RBBP8Q99708 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RBBP8Q99708 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RBBP8Q99708 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RBBP8Q99708 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RBBP8Q99708 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RBBP8Q99708 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RBBP8Q99708 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RBBP8Q99708 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RBBP8Q99708 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RBBP8Q99708 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RBBP8Q99708 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RBBP8Q99708 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RBBP8Q99708 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RBBP8Q99708 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RBBP8Q99708 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RBBP8Q99708 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RBBP8Q99708 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RBBP8Q99708 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RBBP8Q99708 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RBBP8Q99708 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
RBBP8Q99708 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RBBP8Q99708 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RBBP8Q99708 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RBBP8Q99708 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RBBP8Q99708 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RBBP8Q99708 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RBBP8Q99708 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RBBP8Q99708 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RBBP8Q99708 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
RBBP8Q99708 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RBBP8Q99708 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
RBBP8Q99708 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RBBP8Q99708 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RBBP8Q99708 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RBBP8Q99708 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RBBP8Q99708 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RBBP8Q99708 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RBBP8Q99708 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RBBP8Q99708 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RBBP8Q99708 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RBBP8Q99708 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RBBP8Q99708 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RBBP8Q99708 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RBBP8Q99708 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RBBP8Q99708 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RBBP8Q99708 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms