Protein–RNA interactions for Protein: Q99523

SORT1, Sortilin, humanhuman

Predictions only

Length 831 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORT1Q99523 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SORT1Q99523 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
SORT1Q99523 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
SORT1Q99523 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SORT1Q99523 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SORT1Q99523 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SORT1Q99523 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SORT1Q99523 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SORT1Q99523 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SORT1Q99523 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SORT1Q99523 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SORT1Q99523 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SORT1Q99523 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SORT1Q99523 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SORT1Q99523 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SORT1Q99523 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SORT1Q99523 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SORT1Q99523 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SORT1Q99523 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SORT1Q99523 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SORT1Q99523 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SORT1Q99523 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SORT1Q99523 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SORT1Q99523 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SORT1Q99523 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SORT1Q99523 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SORT1Q99523 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SORT1Q99523 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SORT1Q99523 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SORT1Q99523 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SORT1Q99523 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SORT1Q99523 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SORT1Q99523 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SORT1Q99523 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SORT1Q99523 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SORT1Q99523 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SORT1Q99523 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SORT1Q99523 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SORT1Q99523 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SORT1Q99523 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SORT1Q99523 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SORT1Q99523 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SORT1Q99523 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SORT1Q99523 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SORT1Q99523 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SORT1Q99523 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SORT1Q99523 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SORT1Q99523 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SORT1Q99523 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SORT1Q99523 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SORT1Q99523 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SORT1Q99523 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SORT1Q99523 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SORT1Q99523 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SORT1Q99523 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SORT1Q99523 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SORT1Q99523 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SORT1Q99523 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SORT1Q99523 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SORT1Q99523 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SORT1Q99523 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SORT1Q99523 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SORT1Q99523 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SORT1Q99523 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SORT1Q99523 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SORT1Q99523 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SORT1Q99523 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SORT1Q99523 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SORT1Q99523 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SORT1Q99523 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SORT1Q99523 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SORT1Q99523 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SORT1Q99523 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SORT1Q99523 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SORT1Q99523 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SORT1Q99523 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SORT1Q99523 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SORT1Q99523 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SORT1Q99523 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SORT1Q99523 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SORT1Q99523 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SORT1Q99523 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SORT1Q99523 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SORT1Q99523 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SORT1Q99523 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SORT1Q99523 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SORT1Q99523 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SORT1Q99523 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SORT1Q99523 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SORT1Q99523 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SORT1Q99523 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SORT1Q99523 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SORT1Q99523 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SORT1Q99523 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SORT1Q99523 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SORT1Q99523 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SORT1Q99523 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SORT1Q99523 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SORT1Q99523 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SORT1Q99523 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms