Protein–RNA interactions for Protein: Q96SK3

ZNF607, Zinc finger protein 607, humanhuman

Predictions only

Length 696 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF607Q96SK3 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF607Q96SK3 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF607Q96SK3 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF607Q96SK3 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF607Q96SK3 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF607Q96SK3 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ZNF607Q96SK3 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF607Q96SK3 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF607Q96SK3 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF607Q96SK3 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ZNF607Q96SK3 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF607Q96SK3 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ZNF607Q96SK3 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF607Q96SK3 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF607Q96SK3 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF607Q96SK3 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF607Q96SK3 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF607Q96SK3 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF607Q96SK3 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF607Q96SK3 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ZNF607Q96SK3 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF607Q96SK3 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF607Q96SK3 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF607Q96SK3 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF607Q96SK3 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF607Q96SK3 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF607Q96SK3 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF607Q96SK3 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF607Q96SK3 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF607Q96SK3 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF607Q96SK3 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF607Q96SK3 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF607Q96SK3 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF607Q96SK3 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF607Q96SK3 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF607Q96SK3 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF607Q96SK3 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF607Q96SK3 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF607Q96SK3 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF607Q96SK3 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF607Q96SK3 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF607Q96SK3 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF607Q96SK3 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF607Q96SK3 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF607Q96SK3 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF607Q96SK3 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF607Q96SK3 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF607Q96SK3 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF607Q96SK3 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF607Q96SK3 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF607Q96SK3 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF607Q96SK3 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF607Q96SK3 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF607Q96SK3 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF607Q96SK3 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF607Q96SK3 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF607Q96SK3 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF607Q96SK3 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF607Q96SK3 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF607Q96SK3 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF607Q96SK3 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF607Q96SK3 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF607Q96SK3 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF607Q96SK3 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF607Q96SK3 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF607Q96SK3 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF607Q96SK3 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF607Q96SK3 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF607Q96SK3 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF607Q96SK3 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF607Q96SK3 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF607Q96SK3 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF607Q96SK3 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF607Q96SK3 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF607Q96SK3 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF607Q96SK3 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF607Q96SK3 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF607Q96SK3 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF607Q96SK3 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF607Q96SK3 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF607Q96SK3 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF607Q96SK3 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF607Q96SK3 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF607Q96SK3 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF607Q96SK3 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF607Q96SK3 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF607Q96SK3 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF607Q96SK3 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF607Q96SK3 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF607Q96SK3 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF607Q96SK3 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF607Q96SK3 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF607Q96SK3 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF607Q96SK3 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF607Q96SK3 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF607Q96SK3 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF607Q96SK3 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF607Q96SK3 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF607Q96SK3 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF607Q96SK3 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms