Protein–RNA interactions for Protein: Q96SD1

DCLRE1C, Protein artemis, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 692 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCLRE1CQ96SD1 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DCLRE1CQ96SD1 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DCLRE1CQ96SD1 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DCLRE1CQ96SD1 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DCLRE1CQ96SD1 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DCLRE1CQ96SD1 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DCLRE1CQ96SD1 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DCLRE1CQ96SD1 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DCLRE1CQ96SD1 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DCLRE1CQ96SD1 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DCLRE1CQ96SD1 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DCLRE1CQ96SD1 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
DCLRE1CQ96SD1 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DCLRE1CQ96SD1 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DCLRE1CQ96SD1 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DCLRE1CQ96SD1 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DCLRE1CQ96SD1 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DCLRE1CQ96SD1 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DCLRE1CQ96SD1 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DCLRE1CQ96SD1 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DCLRE1CQ96SD1 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DCLRE1CQ96SD1 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DCLRE1CQ96SD1 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DCLRE1CQ96SD1 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DCLRE1CQ96SD1 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
DCLRE1CQ96SD1 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
DCLRE1CQ96SD1 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DCLRE1CQ96SD1 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DCLRE1CQ96SD1 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DCLRE1CQ96SD1 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DCLRE1CQ96SD1 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DCLRE1CQ96SD1 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DCLRE1CQ96SD1 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DCLRE1CQ96SD1 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DCLRE1CQ96SD1 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DCLRE1CQ96SD1 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DCLRE1CQ96SD1 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DCLRE1CQ96SD1 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DCLRE1CQ96SD1 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DCLRE1CQ96SD1 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DCLRE1CQ96SD1 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DCLRE1CQ96SD1 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DCLRE1CQ96SD1 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DCLRE1CQ96SD1 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DCLRE1CQ96SD1 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DCLRE1CQ96SD1 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DCLRE1CQ96SD1 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DCLRE1CQ96SD1 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DCLRE1CQ96SD1 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DCLRE1CQ96SD1 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
DCLRE1CQ96SD1 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DCLRE1CQ96SD1 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DCLRE1CQ96SD1 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DCLRE1CQ96SD1 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DCLRE1CQ96SD1 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DCLRE1CQ96SD1 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DCLRE1CQ96SD1 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DCLRE1CQ96SD1 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DCLRE1CQ96SD1 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DCLRE1CQ96SD1 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DCLRE1CQ96SD1 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DCLRE1CQ96SD1 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
DCLRE1CQ96SD1 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
DCLRE1CQ96SD1 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DCLRE1CQ96SD1 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DCLRE1CQ96SD1 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DCLRE1CQ96SD1 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DCLRE1CQ96SD1 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
DCLRE1CQ96SD1 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DCLRE1CQ96SD1 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DCLRE1CQ96SD1 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DCLRE1CQ96SD1 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DCLRE1CQ96SD1 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DCLRE1CQ96SD1 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DCLRE1CQ96SD1 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DCLRE1CQ96SD1 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
DCLRE1CQ96SD1 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DCLRE1CQ96SD1 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DCLRE1CQ96SD1 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DCLRE1CQ96SD1 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DCLRE1CQ96SD1 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DCLRE1CQ96SD1 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DCLRE1CQ96SD1 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DCLRE1CQ96SD1 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DCLRE1CQ96SD1 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DCLRE1CQ96SD1 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DCLRE1CQ96SD1 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DCLRE1CQ96SD1 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DCLRE1CQ96SD1 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
DCLRE1CQ96SD1 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DCLRE1CQ96SD1 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DCLRE1CQ96SD1 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DCLRE1CQ96SD1 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DCLRE1CQ96SD1 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
DCLRE1CQ96SD1 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DCLRE1CQ96SD1 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DCLRE1CQ96SD1 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DCLRE1CQ96SD1 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DCLRE1CQ96SD1 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DCLRE1CQ96SD1 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms