Protein–RNA interactions for Protein: Q96QS3

ARX, Homeobox protein ARX, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARXQ96QS3 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ARXQ96QS3 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ARXQ96QS3 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ARXQ96QS3 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ARXQ96QS3 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ARXQ96QS3 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ARXQ96QS3 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ARXQ96QS3 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ARXQ96QS3 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ARXQ96QS3 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ARXQ96QS3 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ARXQ96QS3 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ARXQ96QS3 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ARXQ96QS3 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ARXQ96QS3 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
ARXQ96QS3 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ARXQ96QS3 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ARXQ96QS3 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ARXQ96QS3 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ARXQ96QS3 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ARXQ96QS3 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ARXQ96QS3 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ARXQ96QS3 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ARXQ96QS3 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ARXQ96QS3 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ARXQ96QS3 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
ARXQ96QS3 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ARXQ96QS3 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ARXQ96QS3 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ARXQ96QS3 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ARXQ96QS3 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ARXQ96QS3 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ARXQ96QS3 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ARXQ96QS3 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ARXQ96QS3 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ARXQ96QS3 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ARXQ96QS3 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ARXQ96QS3 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ARXQ96QS3 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
ARXQ96QS3 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ARXQ96QS3 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ARXQ96QS3 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ARXQ96QS3 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
ARXQ96QS3 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ARXQ96QS3 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ARXQ96QS3 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ARXQ96QS3 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ARXQ96QS3 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ARXQ96QS3 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ARXQ96QS3 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ARXQ96QS3 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ARXQ96QS3 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ARXQ96QS3 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ARXQ96QS3 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ARXQ96QS3 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ARXQ96QS3 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
ARXQ96QS3 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ARXQ96QS3 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARXQ96QS3 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARXQ96QS3 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARXQ96QS3 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARXQ96QS3 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARXQ96QS3 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARXQ96QS3 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARXQ96QS3 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARXQ96QS3 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARXQ96QS3 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARXQ96QS3 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARXQ96QS3 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARXQ96QS3 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARXQ96QS3 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARXQ96QS3 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
ARXQ96QS3 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARXQ96QS3 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARXQ96QS3 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARXQ96QS3 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARXQ96QS3 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARXQ96QS3 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARXQ96QS3 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARXQ96QS3 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARXQ96QS3 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARXQ96QS3 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARXQ96QS3 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARXQ96QS3 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARXQ96QS3 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARXQ96QS3 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARXQ96QS3 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARXQ96QS3 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARXQ96QS3 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARXQ96QS3 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARXQ96QS3 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARXQ96QS3 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARXQ96QS3 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARXQ96QS3 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARXQ96QS3 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARXQ96QS3 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARXQ96QS3 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARXQ96QS3 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARXQ96QS3 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARXQ96QS3 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.7 ms