Protein–RNA interactions for Protein: Q96MX0

CMTM3, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 182 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM3Q96MX0 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CMTM3Q96MX0 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CMTM3Q96MX0 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CMTM3Q96MX0 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CMTM3Q96MX0 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CMTM3Q96MX0 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CMTM3Q96MX0 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CMTM3Q96MX0 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CMTM3Q96MX0 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CMTM3Q96MX0 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CMTM3Q96MX0 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CMTM3Q96MX0 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CMTM3Q96MX0 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CMTM3Q96MX0 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CMTM3Q96MX0 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CMTM3Q96MX0 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CMTM3Q96MX0 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CMTM3Q96MX0 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CMTM3Q96MX0 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CMTM3Q96MX0 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CMTM3Q96MX0 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CMTM3Q96MX0 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CMTM3Q96MX0 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CMTM3Q96MX0 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CMTM3Q96MX0 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CMTM3Q96MX0 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CMTM3Q96MX0 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CMTM3Q96MX0 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CMTM3Q96MX0 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CMTM3Q96MX0 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CMTM3Q96MX0 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CMTM3Q96MX0 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CMTM3Q96MX0 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CMTM3Q96MX0 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CMTM3Q96MX0 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CMTM3Q96MX0 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CMTM3Q96MX0 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
CMTM3Q96MX0 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CMTM3Q96MX0 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CMTM3Q96MX0 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CMTM3Q96MX0 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CMTM3Q96MX0 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CMTM3Q96MX0 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CMTM3Q96MX0 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CMTM3Q96MX0 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CMTM3Q96MX0 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CMTM3Q96MX0 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CMTM3Q96MX0 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CMTM3Q96MX0 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CMTM3Q96MX0 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CMTM3Q96MX0 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CMTM3Q96MX0 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
CMTM3Q96MX0 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CMTM3Q96MX0 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CMTM3Q96MX0 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CMTM3Q96MX0 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
CMTM3Q96MX0 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
CMTM3Q96MX0 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CMTM3Q96MX0 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CMTM3Q96MX0 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CMTM3Q96MX0 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CMTM3Q96MX0 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CMTM3Q96MX0 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CMTM3Q96MX0 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CMTM3Q96MX0 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
CMTM3Q96MX0 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CMTM3Q96MX0 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CMTM3Q96MX0 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CMTM3Q96MX0 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CMTM3Q96MX0 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CMTM3Q96MX0 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CMTM3Q96MX0 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CMTM3Q96MX0 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CMTM3Q96MX0 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CMTM3Q96MX0 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CMTM3Q96MX0 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CMTM3Q96MX0 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CMTM3Q96MX0 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CMTM3Q96MX0 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CMTM3Q96MX0 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CMTM3Q96MX0 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CMTM3Q96MX0 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CMTM3Q96MX0 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CMTM3Q96MX0 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CMTM3Q96MX0 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CMTM3Q96MX0 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CMTM3Q96MX0 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CMTM3Q96MX0 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CMTM3Q96MX0 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CMTM3Q96MX0 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CMTM3Q96MX0 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CMTM3Q96MX0 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CMTM3Q96MX0 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CMTM3Q96MX0 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CMTM3Q96MX0 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CMTM3Q96MX0 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CMTM3Q96MX0 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CMTM3Q96MX0 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CMTM3Q96MX0 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CMTM3Q96MX0 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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