Protein–RNA interactions for Protein: Q96CE8

TM4SF18, Transmembrane 4 L6 family member 18, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF18Q96CE8 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TM4SF18Q96CE8 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TM4SF18Q96CE8 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TM4SF18Q96CE8 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TM4SF18Q96CE8 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TM4SF18Q96CE8 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TM4SF18Q96CE8 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TM4SF18Q96CE8 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TM4SF18Q96CE8 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TM4SF18Q96CE8 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TM4SF18Q96CE8 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TM4SF18Q96CE8 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TM4SF18Q96CE8 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TM4SF18Q96CE8 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TM4SF18Q96CE8 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TM4SF18Q96CE8 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TM4SF18Q96CE8 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TM4SF18Q96CE8 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TM4SF18Q96CE8 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TM4SF18Q96CE8 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TM4SF18Q96CE8 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TM4SF18Q96CE8 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TM4SF18Q96CE8 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TM4SF18Q96CE8 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TM4SF18Q96CE8 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TM4SF18Q96CE8 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TM4SF18Q96CE8 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TM4SF18Q96CE8 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TM4SF18Q96CE8 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TM4SF18Q96CE8 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TM4SF18Q96CE8 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TM4SF18Q96CE8 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TM4SF18Q96CE8 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TM4SF18Q96CE8 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TM4SF18Q96CE8 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TM4SF18Q96CE8 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TM4SF18Q96CE8 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TM4SF18Q96CE8 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TM4SF18Q96CE8 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TM4SF18Q96CE8 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TM4SF18Q96CE8 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TM4SF18Q96CE8 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TM4SF18Q96CE8 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TM4SF18Q96CE8 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TM4SF18Q96CE8 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TM4SF18Q96CE8 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TM4SF18Q96CE8 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TM4SF18Q96CE8 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TM4SF18Q96CE8 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TM4SF18Q96CE8 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TM4SF18Q96CE8 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TM4SF18Q96CE8 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TM4SF18Q96CE8 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TM4SF18Q96CE8 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TM4SF18Q96CE8 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TM4SF18Q96CE8 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TM4SF18Q96CE8 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TM4SF18Q96CE8 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TM4SF18Q96CE8 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TM4SF18Q96CE8 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TM4SF18Q96CE8 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TM4SF18Q96CE8 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TM4SF18Q96CE8 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TM4SF18Q96CE8 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TM4SF18Q96CE8 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TM4SF18Q96CE8 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TM4SF18Q96CE8 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TM4SF18Q96CE8 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TM4SF18Q96CE8 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TM4SF18Q96CE8 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TM4SF18Q96CE8 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TM4SF18Q96CE8 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TM4SF18Q96CE8 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TM4SF18Q96CE8 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TM4SF18Q96CE8 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TM4SF18Q96CE8 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TM4SF18Q96CE8 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TM4SF18Q96CE8 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TM4SF18Q96CE8 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TM4SF18Q96CE8 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TM4SF18Q96CE8 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TM4SF18Q96CE8 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TM4SF18Q96CE8 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TM4SF18Q96CE8 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TM4SF18Q96CE8 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TM4SF18Q96CE8 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TM4SF18Q96CE8 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TM4SF18Q96CE8 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TM4SF18Q96CE8 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TM4SF18Q96CE8 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TM4SF18Q96CE8 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TM4SF18Q96CE8 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TM4SF18Q96CE8 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TM4SF18Q96CE8 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TM4SF18Q96CE8 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TM4SF18Q96CE8 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TM4SF18Q96CE8 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TM4SF18Q96CE8 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TM4SF18Q96CE8 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TM4SF18Q96CE8 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms