Protein–RNA interactions for Protein: Q96C24

SYTL4, Synaptotagmin-like protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 671 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYTL4Q96C24 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYTL4Q96C24 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYTL4Q96C24 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYTL4Q96C24 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYTL4Q96C24 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYTL4Q96C24 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYTL4Q96C24 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SYTL4Q96C24 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYTL4Q96C24 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SYTL4Q96C24 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYTL4Q96C24 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYTL4Q96C24 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYTL4Q96C24 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYTL4Q96C24 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYTL4Q96C24 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYTL4Q96C24 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYTL4Q96C24 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SYTL4Q96C24 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYTL4Q96C24 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYTL4Q96C24 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYTL4Q96C24 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYTL4Q96C24 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYTL4Q96C24 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYTL4Q96C24 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYTL4Q96C24 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYTL4Q96C24 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SYTL4Q96C24 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYTL4Q96C24 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYTL4Q96C24 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYTL4Q96C24 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYTL4Q96C24 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYTL4Q96C24 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYTL4Q96C24 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYTL4Q96C24 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYTL4Q96C24 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYTL4Q96C24 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYTL4Q96C24 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYTL4Q96C24 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYTL4Q96C24 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYTL4Q96C24 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYTL4Q96C24 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYTL4Q96C24 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYTL4Q96C24 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYTL4Q96C24 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYTL4Q96C24 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYTL4Q96C24 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYTL4Q96C24 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYTL4Q96C24 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SYTL4Q96C24 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYTL4Q96C24 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYTL4Q96C24 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYTL4Q96C24 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYTL4Q96C24 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYTL4Q96C24 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYTL4Q96C24 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYTL4Q96C24 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYTL4Q96C24 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYTL4Q96C24 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYTL4Q96C24 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYTL4Q96C24 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SYTL4Q96C24 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYTL4Q96C24 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SYTL4Q96C24 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SYTL4Q96C24 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SYTL4Q96C24 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYTL4Q96C24 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYTL4Q96C24 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYTL4Q96C24 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYTL4Q96C24 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYTL4Q96C24 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYTL4Q96C24 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYTL4Q96C24 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYTL4Q96C24 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYTL4Q96C24 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYTL4Q96C24 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYTL4Q96C24 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYTL4Q96C24 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYTL4Q96C24 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYTL4Q96C24 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYTL4Q96C24 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYTL4Q96C24 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYTL4Q96C24 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SYTL4Q96C24 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYTL4Q96C24 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SYTL4Q96C24 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SYTL4Q96C24 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYTL4Q96C24 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYTL4Q96C24 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SYTL4Q96C24 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYTL4Q96C24 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYTL4Q96C24 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYTL4Q96C24 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYTL4Q96C24 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYTL4Q96C24 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYTL4Q96C24 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYTL4Q96C24 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYTL4Q96C24 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYTL4Q96C24 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYTL4Q96C24 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYTL4Q96C24 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms