Protein–RNA interactions for Protein: Q969K3

RNF34, E3 ubiquitin-protein ligase RNF34, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF34Q969K3 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RNF34Q969K3 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
RNF34Q969K3 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RNF34Q969K3 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
RNF34Q969K3 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RNF34Q969K3 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RNF34Q969K3 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RNF34Q969K3 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RNF34Q969K3 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RNF34Q969K3 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
RNF34Q969K3 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RNF34Q969K3 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RNF34Q969K3 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RNF34Q969K3 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RNF34Q969K3 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RNF34Q969K3 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RNF34Q969K3 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RNF34Q969K3 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RNF34Q969K3 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RNF34Q969K3 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RNF34Q969K3 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RNF34Q969K3 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RNF34Q969K3 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RNF34Q969K3 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RNF34Q969K3 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RNF34Q969K3 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RNF34Q969K3 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RNF34Q969K3 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RNF34Q969K3 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RNF34Q969K3 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RNF34Q969K3 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RNF34Q969K3 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RNF34Q969K3 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RNF34Q969K3 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RNF34Q969K3 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RNF34Q969K3 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RNF34Q969K3 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RNF34Q969K3 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RNF34Q969K3 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
RNF34Q969K3 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RNF34Q969K3 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RNF34Q969K3 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RNF34Q969K3 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
RNF34Q969K3 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RNF34Q969K3 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RNF34Q969K3 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RNF34Q969K3 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RNF34Q969K3 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RNF34Q969K3 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RNF34Q969K3 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RNF34Q969K3 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RNF34Q969K3 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RNF34Q969K3 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
RNF34Q969K3 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RNF34Q969K3 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RNF34Q969K3 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RNF34Q969K3 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RNF34Q969K3 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RNF34Q969K3 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RNF34Q969K3 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RNF34Q969K3 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RNF34Q969K3 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RNF34Q969K3 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RNF34Q969K3 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RNF34Q969K3 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RNF34Q969K3 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RNF34Q969K3 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RNF34Q969K3 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RNF34Q969K3 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RNF34Q969K3 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RNF34Q969K3 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RNF34Q969K3 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RNF34Q969K3 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RNF34Q969K3 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RNF34Q969K3 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RNF34Q969K3 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RNF34Q969K3 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
RNF34Q969K3 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RNF34Q969K3 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RNF34Q969K3 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RNF34Q969K3 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RNF34Q969K3 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RNF34Q969K3 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RNF34Q969K3 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RNF34Q969K3 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RNF34Q969K3 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RNF34Q969K3 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RNF34Q969K3 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RNF34Q969K3 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RNF34Q969K3 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RNF34Q969K3 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RNF34Q969K3 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RNF34Q969K3 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RNF34Q969K3 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RNF34Q969K3 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RNF34Q969K3 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RNF34Q969K3 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RNF34Q969K3 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RNF34Q969K3 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RNF34Q969K3 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.6 ms