Protein–RNA interactions for Protein: Q969G9

NKD1, Protein naked cuticle homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKD1Q969G9 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NKD1Q969G9 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NKD1Q969G9 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NKD1Q969G9 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
NKD1Q969G9 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NKD1Q969G9 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NKD1Q969G9 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NKD1Q969G9 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NKD1Q969G9 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NKD1Q969G9 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NKD1Q969G9 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NKD1Q969G9 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NKD1Q969G9 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
NKD1Q969G9 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NKD1Q969G9 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NKD1Q969G9 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NKD1Q969G9 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NKD1Q969G9 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NKD1Q969G9 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NKD1Q969G9 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NKD1Q969G9 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NKD1Q969G9 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NKD1Q969G9 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NKD1Q969G9 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NKD1Q969G9 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NKD1Q969G9 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NKD1Q969G9 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
NKD1Q969G9 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NKD1Q969G9 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NKD1Q969G9 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NKD1Q969G9 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NKD1Q969G9 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NKD1Q969G9 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NKD1Q969G9 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NKD1Q969G9 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NKD1Q969G9 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NKD1Q969G9 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NKD1Q969G9 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NKD1Q969G9 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NKD1Q969G9 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NKD1Q969G9 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NKD1Q969G9 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NKD1Q969G9 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NKD1Q969G9 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NKD1Q969G9 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NKD1Q969G9 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
NKD1Q969G9 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NKD1Q969G9 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NKD1Q969G9 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NKD1Q969G9 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NKD1Q969G9 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NKD1Q969G9 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NKD1Q969G9 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
NKD1Q969G9 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
NKD1Q969G9 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NKD1Q969G9 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NKD1Q969G9 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NKD1Q969G9 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NKD1Q969G9 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NKD1Q969G9 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NKD1Q969G9 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NKD1Q969G9 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
NKD1Q969G9 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
NKD1Q969G9 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NKD1Q969G9 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NKD1Q969G9 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NKD1Q969G9 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NKD1Q969G9 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NKD1Q969G9 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NKD1Q969G9 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NKD1Q969G9 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NKD1Q969G9 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NKD1Q969G9 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NKD1Q969G9 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NKD1Q969G9 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NKD1Q969G9 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NKD1Q969G9 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NKD1Q969G9 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NKD1Q969G9 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NKD1Q969G9 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NKD1Q969G9 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NKD1Q969G9 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NKD1Q969G9 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
NKD1Q969G9 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NKD1Q969G9 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NKD1Q969G9 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
NKD1Q969G9 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NKD1Q969G9 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NKD1Q969G9 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NKD1Q969G9 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NKD1Q969G9 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NKD1Q969G9 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NKD1Q969G9 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NKD1Q969G9 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NKD1Q969G9 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NKD1Q969G9 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NKD1Q969G9 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NKD1Q969G9 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NKD1Q969G9 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NKD1Q969G9 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms