Protein–RNA interactions for Protein: Q92826

HOXB13, Homeobox protein Hox-B13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB13Q92826 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXB13Q92826 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXB13Q92826 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXB13Q92826 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXB13Q92826 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXB13Q92826 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXB13Q92826 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXB13Q92826 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXB13Q92826 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXB13Q92826 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXB13Q92826 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXB13Q92826 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXB13Q92826 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXB13Q92826 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXB13Q92826 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXB13Q92826 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXB13Q92826 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXB13Q92826 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXB13Q92826 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXB13Q92826 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXB13Q92826 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXB13Q92826 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXB13Q92826 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXB13Q92826 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXB13Q92826 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXB13Q92826 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXB13Q92826 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXB13Q92826 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXB13Q92826 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXB13Q92826 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXB13Q92826 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXB13Q92826 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXB13Q92826 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXB13Q92826 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXB13Q92826 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXB13Q92826 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXB13Q92826 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXB13Q92826 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXB13Q92826 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXB13Q92826 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXB13Q92826 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXB13Q92826 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXB13Q92826 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXB13Q92826 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXB13Q92826 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXB13Q92826 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXB13Q92826 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXB13Q92826 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXB13Q92826 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXB13Q92826 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXB13Q92826 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXB13Q92826 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXB13Q92826 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXB13Q92826 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXB13Q92826 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXB13Q92826 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXB13Q92826 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXB13Q92826 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXB13Q92826 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXB13Q92826 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXB13Q92826 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXB13Q92826 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXB13Q92826 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXB13Q92826 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXB13Q92826 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXB13Q92826 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXB13Q92826 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXB13Q92826 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXB13Q92826 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXB13Q92826 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXB13Q92826 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXB13Q92826 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXB13Q92826 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXB13Q92826 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXB13Q92826 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXB13Q92826 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXB13Q92826 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXB13Q92826 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXB13Q92826 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXB13Q92826 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXB13Q92826 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXB13Q92826 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXB13Q92826 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXB13Q92826 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXB13Q92826 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXB13Q92826 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXB13Q92826 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXB13Q92826 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXB13Q92826 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXB13Q92826 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXB13Q92826 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXB13Q92826 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXB13Q92826 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXB13Q92826 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXB13Q92826 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXB13Q92826 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXB13Q92826 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXB13Q92826 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXB13Q92826 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXB13Q92826 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms