Protein–RNA interactions for Protein: Q902F9

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113Q902F9 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HERVK_113Q902F9 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HERVK_113Q902F9 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HERVK_113Q902F9 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HERVK_113Q902F9 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
HERVK_113Q902F9 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HERVK_113Q902F9 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HERVK_113Q902F9 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HERVK_113Q902F9 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HERVK_113Q902F9 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HERVK_113Q902F9 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HERVK_113Q902F9 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HERVK_113Q902F9 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HERVK_113Q902F9 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
HERVK_113Q902F9 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
HERVK_113Q902F9 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
HERVK_113Q902F9 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HERVK_113Q902F9 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HERVK_113Q902F9 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HERVK_113Q902F9 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
HERVK_113Q902F9 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HERVK_113Q902F9 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HERVK_113Q902F9 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HERVK_113Q902F9 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HERVK_113Q902F9 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HERVK_113Q902F9 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HERVK_113Q902F9 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HERVK_113Q902F9 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
HERVK_113Q902F9 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HERVK_113Q902F9 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HERVK_113Q902F9 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HERVK_113Q902F9 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HERVK_113Q902F9 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HERVK_113Q902F9 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HERVK_113Q902F9 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HERVK_113Q902F9 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HERVK_113Q902F9 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HERVK_113Q902F9 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HERVK_113Q902F9 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HERVK_113Q902F9 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HERVK_113Q902F9 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HERVK_113Q902F9 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HERVK_113Q902F9 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HERVK_113Q902F9 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HERVK_113Q902F9 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HERVK_113Q902F9 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HERVK_113Q902F9 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HERVK_113Q902F9 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HERVK_113Q902F9 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HERVK_113Q902F9 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HERVK_113Q902F9 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HERVK_113Q902F9 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HERVK_113Q902F9 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HERVK_113Q902F9 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HERVK_113Q902F9 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HERVK_113Q902F9 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HERVK_113Q902F9 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HERVK_113Q902F9 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HERVK_113Q902F9 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HERVK_113Q902F9 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HERVK_113Q902F9 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HERVK_113Q902F9 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
HERVK_113Q902F9 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HERVK_113Q902F9 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HERVK_113Q902F9 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HERVK_113Q902F9 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HERVK_113Q902F9 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HERVK_113Q902F9 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HERVK_113Q902F9 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HERVK_113Q902F9 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HERVK_113Q902F9 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
HERVK_113Q902F9 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
HERVK_113Q902F9 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
HERVK_113Q902F9 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
HERVK_113Q902F9 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
HERVK_113Q902F9 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HERVK_113Q902F9 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HERVK_113Q902F9 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HERVK_113Q902F9 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HERVK_113Q902F9 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HERVK_113Q902F9 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HERVK_113Q902F9 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HERVK_113Q902F9 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HERVK_113Q902F9 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HERVK_113Q902F9 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HERVK_113Q902F9 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
HERVK_113Q902F9 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HERVK_113Q902F9 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HERVK_113Q902F9 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HERVK_113Q902F9 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HERVK_113Q902F9 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HERVK_113Q902F9 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HERVK_113Q902F9 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HERVK_113Q902F9 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HERVK_113Q902F9 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HERVK_113Q902F9 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HERVK_113Q902F9 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HERVK_113Q902F9 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HERVK_113Q902F9 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HERVK_113Q902F9 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.3 ms