Protein–RNA interactions for Protein: Q8WYN3

CSRNP3, Cysteine/serine-rich nuclear protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRNP3Q8WYN3 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CSRNP3Q8WYN3 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CSRNP3Q8WYN3 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CSRNP3Q8WYN3 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CSRNP3Q8WYN3 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
CSRNP3Q8WYN3 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CSRNP3Q8WYN3 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CSRNP3Q8WYN3 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CSRNP3Q8WYN3 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CSRNP3Q8WYN3 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CSRNP3Q8WYN3 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC27.7■■■□□ 2.03
CSRNP3Q8WYN3 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CSRNP3Q8WYN3 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CSRNP3Q8WYN3 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
CSRNP3Q8WYN3 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CSRNP3Q8WYN3 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CSRNP3Q8WYN3 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CSRNP3Q8WYN3 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CSRNP3Q8WYN3 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CSRNP3Q8WYN3 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CSRNP3Q8WYN3 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CSRNP3Q8WYN3 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CSRNP3Q8WYN3 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CSRNP3Q8WYN3 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CSRNP3Q8WYN3 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CSRNP3Q8WYN3 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CSRNP3Q8WYN3 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CSRNP3Q8WYN3 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CSRNP3Q8WYN3 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
CSRNP3Q8WYN3 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CSRNP3Q8WYN3 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CSRNP3Q8WYN3 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CSRNP3Q8WYN3 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CSRNP3Q8WYN3 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CSRNP3Q8WYN3 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CSRNP3Q8WYN3 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CSRNP3Q8WYN3 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CSRNP3Q8WYN3 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CSRNP3Q8WYN3 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CSRNP3Q8WYN3 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CSRNP3Q8WYN3 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CSRNP3Q8WYN3 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CSRNP3Q8WYN3 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CSRNP3Q8WYN3 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CSRNP3Q8WYN3 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CSRNP3Q8WYN3 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CSRNP3Q8WYN3 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CSRNP3Q8WYN3 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CSRNP3Q8WYN3 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CSRNP3Q8WYN3 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
CSRNP3Q8WYN3 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
CSRNP3Q8WYN3 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CSRNP3Q8WYN3 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CSRNP3Q8WYN3 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CSRNP3Q8WYN3 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CSRNP3Q8WYN3 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CSRNP3Q8WYN3 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CSRNP3Q8WYN3 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CSRNP3Q8WYN3 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CSRNP3Q8WYN3 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CSRNP3Q8WYN3 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CSRNP3Q8WYN3 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CSRNP3Q8WYN3 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CSRNP3Q8WYN3 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CSRNP3Q8WYN3 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CSRNP3Q8WYN3 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CSRNP3Q8WYN3 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CSRNP3Q8WYN3 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CSRNP3Q8WYN3 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
CSRNP3Q8WYN3 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CSRNP3Q8WYN3 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CSRNP3Q8WYN3 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
CSRNP3Q8WYN3 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CSRNP3Q8WYN3 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CSRNP3Q8WYN3 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CSRNP3Q8WYN3 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CSRNP3Q8WYN3 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CSRNP3Q8WYN3 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CSRNP3Q8WYN3 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CSRNP3Q8WYN3 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CSRNP3Q8WYN3 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CSRNP3Q8WYN3 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CSRNP3Q8WYN3 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CSRNP3Q8WYN3 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
CSRNP3Q8WYN3 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CSRNP3Q8WYN3 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CSRNP3Q8WYN3 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CSRNP3Q8WYN3 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CSRNP3Q8WYN3 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CSRNP3Q8WYN3 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CSRNP3Q8WYN3 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CSRNP3Q8WYN3 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CSRNP3Q8WYN3 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CSRNP3Q8WYN3 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CSRNP3Q8WYN3 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CSRNP3Q8WYN3 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CSRNP3Q8WYN3 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CSRNP3Q8WYN3 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CSRNP3Q8WYN3 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CSRNP3Q8WYN3 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms