Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBE3

FNDC9, Fibronectin type III domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC9Q8TBE3 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FNDC9Q8TBE3 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FNDC9Q8TBE3 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
FNDC9Q8TBE3 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
FNDC9Q8TBE3 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FNDC9Q8TBE3 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FNDC9Q8TBE3 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FNDC9Q8TBE3 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
FNDC9Q8TBE3 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FNDC9Q8TBE3 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FNDC9Q8TBE3 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FNDC9Q8TBE3 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FNDC9Q8TBE3 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FNDC9Q8TBE3 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FNDC9Q8TBE3 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FNDC9Q8TBE3 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FNDC9Q8TBE3 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FNDC9Q8TBE3 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FNDC9Q8TBE3 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FNDC9Q8TBE3 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FNDC9Q8TBE3 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FNDC9Q8TBE3 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FNDC9Q8TBE3 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FNDC9Q8TBE3 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FNDC9Q8TBE3 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FNDC9Q8TBE3 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FNDC9Q8TBE3 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FNDC9Q8TBE3 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FNDC9Q8TBE3 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FNDC9Q8TBE3 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FNDC9Q8TBE3 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FNDC9Q8TBE3 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FNDC9Q8TBE3 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FNDC9Q8TBE3 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FNDC9Q8TBE3 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FNDC9Q8TBE3 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FNDC9Q8TBE3 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FNDC9Q8TBE3 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FNDC9Q8TBE3 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FNDC9Q8TBE3 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FNDC9Q8TBE3 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FNDC9Q8TBE3 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FNDC9Q8TBE3 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FNDC9Q8TBE3 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FNDC9Q8TBE3 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FNDC9Q8TBE3 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
FNDC9Q8TBE3 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
FNDC9Q8TBE3 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FNDC9Q8TBE3 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
FNDC9Q8TBE3 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FNDC9Q8TBE3 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FNDC9Q8TBE3 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FNDC9Q8TBE3 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FNDC9Q8TBE3 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FNDC9Q8TBE3 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FNDC9Q8TBE3 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FNDC9Q8TBE3 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FNDC9Q8TBE3 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FNDC9Q8TBE3 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FNDC9Q8TBE3 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FNDC9Q8TBE3 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FNDC9Q8TBE3 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FNDC9Q8TBE3 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FNDC9Q8TBE3 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FNDC9Q8TBE3 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FNDC9Q8TBE3 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FNDC9Q8TBE3 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FNDC9Q8TBE3 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FNDC9Q8TBE3 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FNDC9Q8TBE3 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FNDC9Q8TBE3 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FNDC9Q8TBE3 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FNDC9Q8TBE3 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FNDC9Q8TBE3 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FNDC9Q8TBE3 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
FNDC9Q8TBE3 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
FNDC9Q8TBE3 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
FNDC9Q8TBE3 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FNDC9Q8TBE3 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FNDC9Q8TBE3 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FNDC9Q8TBE3 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FNDC9Q8TBE3 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FNDC9Q8TBE3 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FNDC9Q8TBE3 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FNDC9Q8TBE3 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FNDC9Q8TBE3 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FNDC9Q8TBE3 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
FNDC9Q8TBE3 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FNDC9Q8TBE3 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FNDC9Q8TBE3 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FNDC9Q8TBE3 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FNDC9Q8TBE3 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FNDC9Q8TBE3 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FNDC9Q8TBE3 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FNDC9Q8TBE3 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FNDC9Q8TBE3 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FNDC9Q8TBE3 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FNDC9Q8TBE3 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FNDC9Q8TBE3 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FNDC9Q8TBE3 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms