Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEV1

CSNK2A3, Casein kinase II subunit alpha 3, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A3Q8NEV1 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
CSNK2A3Q8NEV1 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CSNK2A3Q8NEV1 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
CSNK2A3Q8NEV1 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CSNK2A3Q8NEV1 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CSNK2A3Q8NEV1 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CSNK2A3Q8NEV1 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CSNK2A3Q8NEV1 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CSNK2A3Q8NEV1 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CSNK2A3Q8NEV1 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CSNK2A3Q8NEV1 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
CSNK2A3Q8NEV1 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CSNK2A3Q8NEV1 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CSNK2A3Q8NEV1 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CSNK2A3Q8NEV1 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CSNK2A3Q8NEV1 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CSNK2A3Q8NEV1 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CSNK2A3Q8NEV1 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CSNK2A3Q8NEV1 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CSNK2A3Q8NEV1 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CSNK2A3Q8NEV1 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CSNK2A3Q8NEV1 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CSNK2A3Q8NEV1 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CSNK2A3Q8NEV1 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CSNK2A3Q8NEV1 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CSNK2A3Q8NEV1 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CSNK2A3Q8NEV1 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
CSNK2A3Q8NEV1 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CSNK2A3Q8NEV1 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CSNK2A3Q8NEV1 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CSNK2A3Q8NEV1 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CSNK2A3Q8NEV1 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CSNK2A3Q8NEV1 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CSNK2A3Q8NEV1 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CSNK2A3Q8NEV1 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CSNK2A3Q8NEV1 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CSNK2A3Q8NEV1 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CSNK2A3Q8NEV1 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CSNK2A3Q8NEV1 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CSNK2A3Q8NEV1 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CSNK2A3Q8NEV1 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
CSNK2A3Q8NEV1 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CSNK2A3Q8NEV1 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CSNK2A3Q8NEV1 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CSNK2A3Q8NEV1 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CSNK2A3Q8NEV1 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CSNK2A3Q8NEV1 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CSNK2A3Q8NEV1 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CSNK2A3Q8NEV1 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CSNK2A3Q8NEV1 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CSNK2A3Q8NEV1 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CSNK2A3Q8NEV1 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CSNK2A3Q8NEV1 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CSNK2A3Q8NEV1 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CSNK2A3Q8NEV1 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CSNK2A3Q8NEV1 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CSNK2A3Q8NEV1 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CSNK2A3Q8NEV1 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CSNK2A3Q8NEV1 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CSNK2A3Q8NEV1 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CSNK2A3Q8NEV1 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CSNK2A3Q8NEV1 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CSNK2A3Q8NEV1 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CSNK2A3Q8NEV1 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CSNK2A3Q8NEV1 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CSNK2A3Q8NEV1 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CSNK2A3Q8NEV1 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CSNK2A3Q8NEV1 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CSNK2A3Q8NEV1 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CSNK2A3Q8NEV1 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CSNK2A3Q8NEV1 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CSNK2A3Q8NEV1 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CSNK2A3Q8NEV1 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CSNK2A3Q8NEV1 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CSNK2A3Q8NEV1 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CSNK2A3Q8NEV1 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CSNK2A3Q8NEV1 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
CSNK2A3Q8NEV1 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CSNK2A3Q8NEV1 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CSNK2A3Q8NEV1 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CSNK2A3Q8NEV1 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CSNK2A3Q8NEV1 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CSNK2A3Q8NEV1 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CSNK2A3Q8NEV1 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CSNK2A3Q8NEV1 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CSNK2A3Q8NEV1 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CSNK2A3Q8NEV1 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC14.96□□□□□ -0.02
CSNK2A3Q8NEV1 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
CSNK2A3Q8NEV1 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CSNK2A3Q8NEV1 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
CSNK2A3Q8NEV1 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
CSNK2A3Q8NEV1 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CSNK2A3Q8NEV1 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CSNK2A3Q8NEV1 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CSNK2A3Q8NEV1 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CSNK2A3Q8NEV1 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CSNK2A3Q8NEV1 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CSNK2A3Q8NEV1 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CSNK2A3Q8NEV1 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CSNK2A3Q8NEV1 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.8 ms