Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCD3

HJURP, Holliday junction recognition protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HJURPQ8NCD3 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HJURPQ8NCD3 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HJURPQ8NCD3 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HJURPQ8NCD3 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
HJURPQ8NCD3 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HJURPQ8NCD3 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HJURPQ8NCD3 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HJURPQ8NCD3 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HJURPQ8NCD3 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HJURPQ8NCD3 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HJURPQ8NCD3 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HJURPQ8NCD3 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HJURPQ8NCD3 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HJURPQ8NCD3 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HJURPQ8NCD3 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HJURPQ8NCD3 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HJURPQ8NCD3 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HJURPQ8NCD3 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HJURPQ8NCD3 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HJURPQ8NCD3 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HJURPQ8NCD3 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HJURPQ8NCD3 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HJURPQ8NCD3 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HJURPQ8NCD3 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HJURPQ8NCD3 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HJURPQ8NCD3 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HJURPQ8NCD3 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
HJURPQ8NCD3 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HJURPQ8NCD3 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HJURPQ8NCD3 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HJURPQ8NCD3 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HJURPQ8NCD3 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HJURPQ8NCD3 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
HJURPQ8NCD3 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HJURPQ8NCD3 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HJURPQ8NCD3 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HJURPQ8NCD3 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HJURPQ8NCD3 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HJURPQ8NCD3 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HJURPQ8NCD3 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HJURPQ8NCD3 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
HJURPQ8NCD3 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HJURPQ8NCD3 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HJURPQ8NCD3 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HJURPQ8NCD3 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HJURPQ8NCD3 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HJURPQ8NCD3 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HJURPQ8NCD3 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HJURPQ8NCD3 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HJURPQ8NCD3 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HJURPQ8NCD3 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
HJURPQ8NCD3 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HJURPQ8NCD3 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HJURPQ8NCD3 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HJURPQ8NCD3 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HJURPQ8NCD3 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HJURPQ8NCD3 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HJURPQ8NCD3 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HJURPQ8NCD3 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HJURPQ8NCD3 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HJURPQ8NCD3 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HJURPQ8NCD3 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HJURPQ8NCD3 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HJURPQ8NCD3 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HJURPQ8NCD3 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HJURPQ8NCD3 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HJURPQ8NCD3 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HJURPQ8NCD3 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HJURPQ8NCD3 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HJURPQ8NCD3 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HJURPQ8NCD3 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HJURPQ8NCD3 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HJURPQ8NCD3 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HJURPQ8NCD3 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
HJURPQ8NCD3 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HJURPQ8NCD3 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HJURPQ8NCD3 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HJURPQ8NCD3 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HJURPQ8NCD3 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HJURPQ8NCD3 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HJURPQ8NCD3 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HJURPQ8NCD3 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HJURPQ8NCD3 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HJURPQ8NCD3 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HJURPQ8NCD3 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HJURPQ8NCD3 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HJURPQ8NCD3 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HJURPQ8NCD3 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HJURPQ8NCD3 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HJURPQ8NCD3 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HJURPQ8NCD3 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HJURPQ8NCD3 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HJURPQ8NCD3 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HJURPQ8NCD3 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HJURPQ8NCD3 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HJURPQ8NCD3 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HJURPQ8NCD3 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HJURPQ8NCD3 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
HJURPQ8NCD3 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HJURPQ8NCD3 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.4 ms