Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6Y2

LRRC17, Leucine-rich repeat-containing protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC17Q8N6Y2 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
LRRC17Q8N6Y2 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LRRC17Q8N6Y2 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LRRC17Q8N6Y2 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LRRC17Q8N6Y2 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LRRC17Q8N6Y2 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LRRC17Q8N6Y2 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LRRC17Q8N6Y2 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LRRC17Q8N6Y2 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LRRC17Q8N6Y2 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LRRC17Q8N6Y2 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LRRC17Q8N6Y2 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LRRC17Q8N6Y2 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LRRC17Q8N6Y2 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LRRC17Q8N6Y2 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LRRC17Q8N6Y2 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LRRC17Q8N6Y2 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LRRC17Q8N6Y2 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LRRC17Q8N6Y2 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LRRC17Q8N6Y2 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LRRC17Q8N6Y2 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LRRC17Q8N6Y2 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LRRC17Q8N6Y2 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LRRC17Q8N6Y2 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LRRC17Q8N6Y2 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LRRC17Q8N6Y2 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LRRC17Q8N6Y2 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LRRC17Q8N6Y2 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LRRC17Q8N6Y2 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LRRC17Q8N6Y2 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LRRC17Q8N6Y2 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
LRRC17Q8N6Y2 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LRRC17Q8N6Y2 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LRRC17Q8N6Y2 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LRRC17Q8N6Y2 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LRRC17Q8N6Y2 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LRRC17Q8N6Y2 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
LRRC17Q8N6Y2 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LRRC17Q8N6Y2 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LRRC17Q8N6Y2 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LRRC17Q8N6Y2 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LRRC17Q8N6Y2 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LRRC17Q8N6Y2 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LRRC17Q8N6Y2 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LRRC17Q8N6Y2 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
LRRC17Q8N6Y2 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LRRC17Q8N6Y2 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
LRRC17Q8N6Y2 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LRRC17Q8N6Y2 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LRRC17Q8N6Y2 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LRRC17Q8N6Y2 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LRRC17Q8N6Y2 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LRRC17Q8N6Y2 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LRRC17Q8N6Y2 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LRRC17Q8N6Y2 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LRRC17Q8N6Y2 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LRRC17Q8N6Y2 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LRRC17Q8N6Y2 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LRRC17Q8N6Y2 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LRRC17Q8N6Y2 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
LRRC17Q8N6Y2 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LRRC17Q8N6Y2 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LRRC17Q8N6Y2 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LRRC17Q8N6Y2 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LRRC17Q8N6Y2 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LRRC17Q8N6Y2 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
LRRC17Q8N6Y2 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LRRC17Q8N6Y2 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LRRC17Q8N6Y2 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LRRC17Q8N6Y2 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LRRC17Q8N6Y2 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LRRC17Q8N6Y2 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LRRC17Q8N6Y2 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LRRC17Q8N6Y2 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
LRRC17Q8N6Y2 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LRRC17Q8N6Y2 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LRRC17Q8N6Y2 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LRRC17Q8N6Y2 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LRRC17Q8N6Y2 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LRRC17Q8N6Y2 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LRRC17Q8N6Y2 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LRRC17Q8N6Y2 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LRRC17Q8N6Y2 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LRRC17Q8N6Y2 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
LRRC17Q8N6Y2 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LRRC17Q8N6Y2 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LRRC17Q8N6Y2 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LRRC17Q8N6Y2 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LRRC17Q8N6Y2 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LRRC17Q8N6Y2 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LRRC17Q8N6Y2 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LRRC17Q8N6Y2 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LRRC17Q8N6Y2 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LRRC17Q8N6Y2 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LRRC17Q8N6Y2 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
LRRC17Q8N6Y2 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LRRC17Q8N6Y2 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LRRC17Q8N6Y2 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LRRC17Q8N6Y2 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LRRC17Q8N6Y2 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms