Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4V2

SVOP, Synaptic vesicle 2-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVOPQ8N4V2 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SVOPQ8N4V2 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SVOPQ8N4V2 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SVOPQ8N4V2 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SVOPQ8N4V2 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SVOPQ8N4V2 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SVOPQ8N4V2 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SVOPQ8N4V2 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SVOPQ8N4V2 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SVOPQ8N4V2 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SVOPQ8N4V2 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SVOPQ8N4V2 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SVOPQ8N4V2 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SVOPQ8N4V2 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SVOPQ8N4V2 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SVOPQ8N4V2 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SVOPQ8N4V2 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SVOPQ8N4V2 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SVOPQ8N4V2 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SVOPQ8N4V2 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SVOPQ8N4V2 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SVOPQ8N4V2 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SVOPQ8N4V2 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SVOPQ8N4V2 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SVOPQ8N4V2 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SVOPQ8N4V2 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SVOPQ8N4V2 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SVOPQ8N4V2 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SVOPQ8N4V2 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SVOPQ8N4V2 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SVOPQ8N4V2 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SVOPQ8N4V2 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SVOPQ8N4V2 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SVOPQ8N4V2 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SVOPQ8N4V2 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SVOPQ8N4V2 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SVOPQ8N4V2 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SVOPQ8N4V2 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SVOPQ8N4V2 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SVOPQ8N4V2 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SVOPQ8N4V2 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SVOPQ8N4V2 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SVOPQ8N4V2 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SVOPQ8N4V2 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SVOPQ8N4V2 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SVOPQ8N4V2 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SVOPQ8N4V2 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SVOPQ8N4V2 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SVOPQ8N4V2 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SVOPQ8N4V2 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SVOPQ8N4V2 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SVOPQ8N4V2 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SVOPQ8N4V2 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SVOPQ8N4V2 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SVOPQ8N4V2 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SVOPQ8N4V2 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SVOPQ8N4V2 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SVOPQ8N4V2 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SVOPQ8N4V2 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SVOPQ8N4V2 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SVOPQ8N4V2 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SVOPQ8N4V2 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SVOPQ8N4V2 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SVOPQ8N4V2 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SVOPQ8N4V2 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SVOPQ8N4V2 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SVOPQ8N4V2 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SVOPQ8N4V2 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SVOPQ8N4V2 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SVOPQ8N4V2 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SVOPQ8N4V2 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SVOPQ8N4V2 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SVOPQ8N4V2 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SVOPQ8N4V2 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SVOPQ8N4V2 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SVOPQ8N4V2 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SVOPQ8N4V2 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SVOPQ8N4V2 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SVOPQ8N4V2 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SVOPQ8N4V2 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SVOPQ8N4V2 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SVOPQ8N4V2 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SVOPQ8N4V2 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SVOPQ8N4V2 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SVOPQ8N4V2 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SVOPQ8N4V2 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SVOPQ8N4V2 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SVOPQ8N4V2 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SVOPQ8N4V2 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SVOPQ8N4V2 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SVOPQ8N4V2 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SVOPQ8N4V2 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SVOPQ8N4V2 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SVOPQ8N4V2 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SVOPQ8N4V2 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SVOPQ8N4V2 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SVOPQ8N4V2 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SVOPQ8N4V2 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SVOPQ8N4V2 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SVOPQ8N4V2 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms