Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW5

RPAP2, Putative RNA polymerase II subunit B1 CTD phosphatase RPAP2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAP2Q8IXW5 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
RPAP2Q8IXW5 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
RPAP2Q8IXW5 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RPAP2Q8IXW5 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
RPAP2Q8IXW5 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
RPAP2Q8IXW5 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
RPAP2Q8IXW5 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
RPAP2Q8IXW5 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
RPAP2Q8IXW5 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
RPAP2Q8IXW5 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RPAP2Q8IXW5 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RPAP2Q8IXW5 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RPAP2Q8IXW5 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RPAP2Q8IXW5 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RPAP2Q8IXW5 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RPAP2Q8IXW5 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RPAP2Q8IXW5 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RPAP2Q8IXW5 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RPAP2Q8IXW5 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RPAP2Q8IXW5 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RPAP2Q8IXW5 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RPAP2Q8IXW5 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RPAP2Q8IXW5 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RPAP2Q8IXW5 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RPAP2Q8IXW5 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
RPAP2Q8IXW5 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
RPAP2Q8IXW5 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
RPAP2Q8IXW5 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
RPAP2Q8IXW5 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RPAP2Q8IXW5 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RPAP2Q8IXW5 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
RPAP2Q8IXW5 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
RPAP2Q8IXW5 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
RPAP2Q8IXW5 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RPAP2Q8IXW5 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RPAP2Q8IXW5 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RPAP2Q8IXW5 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RPAP2Q8IXW5 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPAP2Q8IXW5 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPAP2Q8IXW5 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPAP2Q8IXW5 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPAP2Q8IXW5 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPAP2Q8IXW5 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPAP2Q8IXW5 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPAP2Q8IXW5 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPAP2Q8IXW5 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
RPAP2Q8IXW5 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPAP2Q8IXW5 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPAP2Q8IXW5 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPAP2Q8IXW5 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPAP2Q8IXW5 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPAP2Q8IXW5 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPAP2Q8IXW5 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
RPAP2Q8IXW5 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
RPAP2Q8IXW5 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPAP2Q8IXW5 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPAP2Q8IXW5 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPAP2Q8IXW5 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
RPAP2Q8IXW5 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPAP2Q8IXW5 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPAP2Q8IXW5 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
RPAP2Q8IXW5 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPAP2Q8IXW5 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPAP2Q8IXW5 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPAP2Q8IXW5 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
RPAP2Q8IXW5 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPAP2Q8IXW5 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RPAP2Q8IXW5 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RPAP2Q8IXW5 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RPAP2Q8IXW5 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RPAP2Q8IXW5 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RPAP2Q8IXW5 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RPAP2Q8IXW5 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RPAP2Q8IXW5 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RPAP2Q8IXW5 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RPAP2Q8IXW5 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RPAP2Q8IXW5 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RPAP2Q8IXW5 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RPAP2Q8IXW5 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RPAP2Q8IXW5 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RPAP2Q8IXW5 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
RPAP2Q8IXW5 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
RPAP2Q8IXW5 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
RPAP2Q8IXW5 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RPAP2Q8IXW5 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RPAP2Q8IXW5 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RPAP2Q8IXW5 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RPAP2Q8IXW5 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RPAP2Q8IXW5 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
RPAP2Q8IXW5 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RPAP2Q8IXW5 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RPAP2Q8IXW5 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RPAP2Q8IXW5 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
RPAP2Q8IXW5 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RPAP2Q8IXW5 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
RPAP2Q8IXW5 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
RPAP2Q8IXW5 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RPAP2Q8IXW5 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RPAP2Q8IXW5 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
RPAP2Q8IXW5 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms