Protein–RNA interactions for Protein: Q76N89

HECW1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, humanhuman

Predictions only

Length 1,606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECW1Q76N89 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
HECW1Q76N89 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
HECW1Q76N89 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
HECW1Q76N89 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
HECW1Q76N89 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
HECW1Q76N89 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
HECW1Q76N89 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
HECW1Q76N89 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
HECW1Q76N89 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
HECW1Q76N89 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
HECW1Q76N89 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
HECW1Q76N89 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
HECW1Q76N89 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
HECW1Q76N89 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
HECW1Q76N89 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
HECW1Q76N89 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
HECW1Q76N89 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
HECW1Q76N89 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
HECW1Q76N89 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
HECW1Q76N89 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
HECW1Q76N89 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC26.21■■□□□ 1.79
HECW1Q76N89 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
HECW1Q76N89 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
HECW1Q76N89 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC26.21■■□□□ 1.79
HECW1Q76N89 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
HECW1Q76N89 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
HECW1Q76N89 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
HECW1Q76N89 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
HECW1Q76N89 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
HECW1Q76N89 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
HECW1Q76N89 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
HECW1Q76N89 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
HECW1Q76N89 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
HECW1Q76N89 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
HECW1Q76N89 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
HECW1Q76N89 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
HECW1Q76N89 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
HECW1Q76N89 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
HECW1Q76N89 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
HECW1Q76N89 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
HECW1Q76N89 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
HECW1Q76N89 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
HECW1Q76N89 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
HECW1Q76N89 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
HECW1Q76N89 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
HECW1Q76N89 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
HECW1Q76N89 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
HECW1Q76N89 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
HECW1Q76N89 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
HECW1Q76N89 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
HECW1Q76N89 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
HECW1Q76N89 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
HECW1Q76N89 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
HECW1Q76N89 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
HECW1Q76N89 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
HECW1Q76N89 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
HECW1Q76N89 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC26.18■■□□□ 1.78
HECW1Q76N89 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
HECW1Q76N89 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
HECW1Q76N89 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
HECW1Q76N89 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
HECW1Q76N89 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
HECW1Q76N89 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
HECW1Q76N89 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
HECW1Q76N89 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
HECW1Q76N89 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
HECW1Q76N89 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
HECW1Q76N89 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
HECW1Q76N89 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
HECW1Q76N89 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
HECW1Q76N89 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
HECW1Q76N89 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
HECW1Q76N89 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
HECW1Q76N89 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
HECW1Q76N89 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
HECW1Q76N89 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
HECW1Q76N89 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
HECW1Q76N89 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC26.17■■□□□ 1.78
HECW1Q76N89 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
HECW1Q76N89 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
HECW1Q76N89 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
HECW1Q76N89 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
HECW1Q76N89 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
HECW1Q76N89 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
HECW1Q76N89 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
HECW1Q76N89 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
HECW1Q76N89 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
HECW1Q76N89 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
HECW1Q76N89 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
HECW1Q76N89 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
HECW1Q76N89 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
HECW1Q76N89 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
HECW1Q76N89 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
HECW1Q76N89 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
HECW1Q76N89 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
HECW1Q76N89 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
HECW1Q76N89 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
HECW1Q76N89 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
HECW1Q76N89 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
HECW1Q76N89 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms