Protein–RNA interactions for Protein: Q6NUQ1

RINT1, RAD50-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 792 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RINT1Q6NUQ1 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RINT1Q6NUQ1 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RINT1Q6NUQ1 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RINT1Q6NUQ1 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RINT1Q6NUQ1 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RINT1Q6NUQ1 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RINT1Q6NUQ1 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RINT1Q6NUQ1 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RINT1Q6NUQ1 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
RINT1Q6NUQ1 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RINT1Q6NUQ1 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RINT1Q6NUQ1 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RINT1Q6NUQ1 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RINT1Q6NUQ1 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RINT1Q6NUQ1 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RINT1Q6NUQ1 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RINT1Q6NUQ1 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RINT1Q6NUQ1 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RINT1Q6NUQ1 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RINT1Q6NUQ1 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RINT1Q6NUQ1 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RINT1Q6NUQ1 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RINT1Q6NUQ1 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RINT1Q6NUQ1 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RINT1Q6NUQ1 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RINT1Q6NUQ1 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RINT1Q6NUQ1 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RINT1Q6NUQ1 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RINT1Q6NUQ1 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RINT1Q6NUQ1 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RINT1Q6NUQ1 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RINT1Q6NUQ1 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RINT1Q6NUQ1 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RINT1Q6NUQ1 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RINT1Q6NUQ1 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RINT1Q6NUQ1 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RINT1Q6NUQ1 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RINT1Q6NUQ1 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RINT1Q6NUQ1 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RINT1Q6NUQ1 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RINT1Q6NUQ1 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RINT1Q6NUQ1 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RINT1Q6NUQ1 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RINT1Q6NUQ1 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RINT1Q6NUQ1 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RINT1Q6NUQ1 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RINT1Q6NUQ1 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
RINT1Q6NUQ1 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RINT1Q6NUQ1 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
RINT1Q6NUQ1 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RINT1Q6NUQ1 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
RINT1Q6NUQ1 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RINT1Q6NUQ1 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RINT1Q6NUQ1 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RINT1Q6NUQ1 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
RINT1Q6NUQ1 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
RINT1Q6NUQ1 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RINT1Q6NUQ1 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RINT1Q6NUQ1 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RINT1Q6NUQ1 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RINT1Q6NUQ1 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RINT1Q6NUQ1 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RINT1Q6NUQ1 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RINT1Q6NUQ1 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RINT1Q6NUQ1 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RINT1Q6NUQ1 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RINT1Q6NUQ1 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RINT1Q6NUQ1 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RINT1Q6NUQ1 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RINT1Q6NUQ1 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RINT1Q6NUQ1 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RINT1Q6NUQ1 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RINT1Q6NUQ1 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RINT1Q6NUQ1 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RINT1Q6NUQ1 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RINT1Q6NUQ1 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RINT1Q6NUQ1 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
RINT1Q6NUQ1 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
RINT1Q6NUQ1 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RINT1Q6NUQ1 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RINT1Q6NUQ1 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RINT1Q6NUQ1 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RINT1Q6NUQ1 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RINT1Q6NUQ1 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RINT1Q6NUQ1 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RINT1Q6NUQ1 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RINT1Q6NUQ1 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RINT1Q6NUQ1 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
RINT1Q6NUQ1 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RINT1Q6NUQ1 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RINT1Q6NUQ1 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RINT1Q6NUQ1 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RINT1Q6NUQ1 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RINT1Q6NUQ1 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RINT1Q6NUQ1 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RINT1Q6NUQ1 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RINT1Q6NUQ1 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RINT1Q6NUQ1 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
RINT1Q6NUQ1 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RINT1Q6NUQ1 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms