Protein–RNA interactions for Protein: Q5U3C3

TMEM164, Transmembrane protein 164, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM164Q5U3C3 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM164Q5U3C3 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM164Q5U3C3 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM164Q5U3C3 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM164Q5U3C3 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM164Q5U3C3 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM164Q5U3C3 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM164Q5U3C3 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM164Q5U3C3 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM164Q5U3C3 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM164Q5U3C3 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM164Q5U3C3 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM164Q5U3C3 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM164Q5U3C3 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM164Q5U3C3 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM164Q5U3C3 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM164Q5U3C3 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM164Q5U3C3 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM164Q5U3C3 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM164Q5U3C3 BX547991.1-201ENST00000582543 1206 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM164Q5U3C3 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM164Q5U3C3 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM164Q5U3C3 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM164Q5U3C3 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM164Q5U3C3 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM164Q5U3C3 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM164Q5U3C3 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM164Q5U3C3 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM164Q5U3C3 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM164Q5U3C3 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM164Q5U3C3 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM164Q5U3C3 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM164Q5U3C3 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM164Q5U3C3 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM164Q5U3C3 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM164Q5U3C3 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM164Q5U3C3 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM164Q5U3C3 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM164Q5U3C3 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM164Q5U3C3 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM164Q5U3C3 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM164Q5U3C3 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM164Q5U3C3 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM164Q5U3C3 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM164Q5U3C3 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM164Q5U3C3 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM164Q5U3C3 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM164Q5U3C3 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM164Q5U3C3 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM164Q5U3C3 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM164Q5U3C3 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM164Q5U3C3 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM164Q5U3C3 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM164Q5U3C3 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM164Q5U3C3 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM164Q5U3C3 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM164Q5U3C3 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM164Q5U3C3 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM164Q5U3C3 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM164Q5U3C3 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM164Q5U3C3 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM164Q5U3C3 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM164Q5U3C3 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM164Q5U3C3 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM164Q5U3C3 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM164Q5U3C3 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM164Q5U3C3 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM164Q5U3C3 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM164Q5U3C3 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TMEM164Q5U3C3 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TMEM164Q5U3C3 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TMEM164Q5U3C3 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
TMEM164Q5U3C3 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TMEM164Q5U3C3 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TMEM164Q5U3C3 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TMEM164Q5U3C3 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TMEM164Q5U3C3 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM164Q5U3C3 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM164Q5U3C3 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM164Q5U3C3 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM164Q5U3C3 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM164Q5U3C3 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM164Q5U3C3 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM164Q5U3C3 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM164Q5U3C3 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM164Q5U3C3 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM164Q5U3C3 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM164Q5U3C3 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM164Q5U3C3 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM164Q5U3C3 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM164Q5U3C3 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM164Q5U3C3 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM164Q5U3C3 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM164Q5U3C3 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM164Q5U3C3 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM164Q5U3C3 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM164Q5U3C3 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM164Q5U3C3 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM164Q5U3C3 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM164Q5U3C3 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms