Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGS1

HES3, Transcription factor HES-3, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HES3Q5TGS1 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HES3Q5TGS1 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HES3Q5TGS1 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HES3Q5TGS1 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HES3Q5TGS1 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HES3Q5TGS1 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HES3Q5TGS1 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HES3Q5TGS1 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HES3Q5TGS1 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HES3Q5TGS1 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HES3Q5TGS1 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HES3Q5TGS1 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HES3Q5TGS1 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HES3Q5TGS1 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HES3Q5TGS1 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HES3Q5TGS1 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HES3Q5TGS1 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HES3Q5TGS1 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HES3Q5TGS1 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HES3Q5TGS1 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HES3Q5TGS1 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HES3Q5TGS1 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HES3Q5TGS1 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HES3Q5TGS1 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HES3Q5TGS1 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
HES3Q5TGS1 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HES3Q5TGS1 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HES3Q5TGS1 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HES3Q5TGS1 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HES3Q5TGS1 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HES3Q5TGS1 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HES3Q5TGS1 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HES3Q5TGS1 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HES3Q5TGS1 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HES3Q5TGS1 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HES3Q5TGS1 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HES3Q5TGS1 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HES3Q5TGS1 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HES3Q5TGS1 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HES3Q5TGS1 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HES3Q5TGS1 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HES3Q5TGS1 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HES3Q5TGS1 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HES3Q5TGS1 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HES3Q5TGS1 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HES3Q5TGS1 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HES3Q5TGS1 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HES3Q5TGS1 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
HES3Q5TGS1 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HES3Q5TGS1 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HES3Q5TGS1 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
HES3Q5TGS1 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HES3Q5TGS1 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
HES3Q5TGS1 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
HES3Q5TGS1 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HES3Q5TGS1 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HES3Q5TGS1 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HES3Q5TGS1 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HES3Q5TGS1 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HES3Q5TGS1 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HES3Q5TGS1 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
HES3Q5TGS1 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HES3Q5TGS1 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HES3Q5TGS1 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
HES3Q5TGS1 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HES3Q5TGS1 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HES3Q5TGS1 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HES3Q5TGS1 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HES3Q5TGS1 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HES3Q5TGS1 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HES3Q5TGS1 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
HES3Q5TGS1 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HES3Q5TGS1 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HES3Q5TGS1 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HES3Q5TGS1 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HES3Q5TGS1 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HES3Q5TGS1 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HES3Q5TGS1 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HES3Q5TGS1 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HES3Q5TGS1 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
HES3Q5TGS1 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HES3Q5TGS1 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HES3Q5TGS1 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HES3Q5TGS1 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HES3Q5TGS1 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HES3Q5TGS1 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HES3Q5TGS1 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HES3Q5TGS1 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HES3Q5TGS1 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HES3Q5TGS1 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
HES3Q5TGS1 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
HES3Q5TGS1 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
HES3Q5TGS1 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HES3Q5TGS1 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HES3Q5TGS1 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HES3Q5TGS1 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HES3Q5TGS1 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HES3Q5TGS1 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HES3Q5TGS1 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HES3Q5TGS1 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.1 ms