Protein–RNA interactions for Protein: Q5JUK3

KCNT1, Potassium channel subfamily T member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNT1Q5JUK3 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KCNT1Q5JUK3 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KCNT1Q5JUK3 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KCNT1Q5JUK3 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KCNT1Q5JUK3 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KCNT1Q5JUK3 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KCNT1Q5JUK3 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
KCNT1Q5JUK3 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KCNT1Q5JUK3 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KCNT1Q5JUK3 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KCNT1Q5JUK3 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KCNT1Q5JUK3 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KCNT1Q5JUK3 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KCNT1Q5JUK3 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KCNT1Q5JUK3 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KCNT1Q5JUK3 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KCNT1Q5JUK3 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KCNT1Q5JUK3 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KCNT1Q5JUK3 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KCNT1Q5JUK3 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KCNT1Q5JUK3 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KCNT1Q5JUK3 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
KCNT1Q5JUK3 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KCNT1Q5JUK3 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KCNT1Q5JUK3 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KCNT1Q5JUK3 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KCNT1Q5JUK3 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KCNT1Q5JUK3 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KCNT1Q5JUK3 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KCNT1Q5JUK3 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KCNT1Q5JUK3 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KCNT1Q5JUK3 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KCNT1Q5JUK3 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KCNT1Q5JUK3 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KCNT1Q5JUK3 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KCNT1Q5JUK3 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KCNT1Q5JUK3 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KCNT1Q5JUK3 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KCNT1Q5JUK3 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KCNT1Q5JUK3 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KCNT1Q5JUK3 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KCNT1Q5JUK3 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KCNT1Q5JUK3 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KCNT1Q5JUK3 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KCNT1Q5JUK3 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KCNT1Q5JUK3 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KCNT1Q5JUK3 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KCNT1Q5JUK3 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KCNT1Q5JUK3 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KCNT1Q5JUK3 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KCNT1Q5JUK3 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KCNT1Q5JUK3 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KCNT1Q5JUK3 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KCNT1Q5JUK3 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
KCNT1Q5JUK3 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KCNT1Q5JUK3 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KCNT1Q5JUK3 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KCNT1Q5JUK3 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KCNT1Q5JUK3 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KCNT1Q5JUK3 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
KCNT1Q5JUK3 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KCNT1Q5JUK3 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KCNT1Q5JUK3 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KCNT1Q5JUK3 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KCNT1Q5JUK3 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KCNT1Q5JUK3 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KCNT1Q5JUK3 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KCNT1Q5JUK3 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KCNT1Q5JUK3 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KCNT1Q5JUK3 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KCNT1Q5JUK3 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
KCNT1Q5JUK3 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KCNT1Q5JUK3 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KCNT1Q5JUK3 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KCNT1Q5JUK3 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KCNT1Q5JUK3 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KCNT1Q5JUK3 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KCNT1Q5JUK3 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
KCNT1Q5JUK3 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KCNT1Q5JUK3 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KCNT1Q5JUK3 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
KCNT1Q5JUK3 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
KCNT1Q5JUK3 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KCNT1Q5JUK3 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KCNT1Q5JUK3 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KCNT1Q5JUK3 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KCNT1Q5JUK3 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KCNT1Q5JUK3 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KCNT1Q5JUK3 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
KCNT1Q5JUK3 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
KCNT1Q5JUK3 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
KCNT1Q5JUK3 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KCNT1Q5JUK3 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
KCNT1Q5JUK3 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KCNT1Q5JUK3 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
KCNT1Q5JUK3 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
KCNT1Q5JUK3 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KCNT1Q5JUK3 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
KCNT1Q5JUK3 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KCNT1Q5JUK3 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms