Protein–RNA interactions for Protein: Q5JSH3

WDR44, WD repeat-containing protein 44, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR44Q5JSH3 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
WDR44Q5JSH3 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
WDR44Q5JSH3 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
WDR44Q5JSH3 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
WDR44Q5JSH3 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
WDR44Q5JSH3 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
WDR44Q5JSH3 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
WDR44Q5JSH3 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
WDR44Q5JSH3 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
WDR44Q5JSH3 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
WDR44Q5JSH3 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
WDR44Q5JSH3 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
WDR44Q5JSH3 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
WDR44Q5JSH3 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
WDR44Q5JSH3 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
WDR44Q5JSH3 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
WDR44Q5JSH3 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
WDR44Q5JSH3 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
WDR44Q5JSH3 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
WDR44Q5JSH3 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
WDR44Q5JSH3 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
WDR44Q5JSH3 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
WDR44Q5JSH3 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
WDR44Q5JSH3 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
WDR44Q5JSH3 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
WDR44Q5JSH3 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
WDR44Q5JSH3 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
WDR44Q5JSH3 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
WDR44Q5JSH3 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
WDR44Q5JSH3 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
WDR44Q5JSH3 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
WDR44Q5JSH3 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
WDR44Q5JSH3 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
WDR44Q5JSH3 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
WDR44Q5JSH3 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
WDR44Q5JSH3 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
WDR44Q5JSH3 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
WDR44Q5JSH3 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
WDR44Q5JSH3 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
WDR44Q5JSH3 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
WDR44Q5JSH3 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
WDR44Q5JSH3 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
WDR44Q5JSH3 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
WDR44Q5JSH3 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
WDR44Q5JSH3 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
WDR44Q5JSH3 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
WDR44Q5JSH3 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
WDR44Q5JSH3 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
WDR44Q5JSH3 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
WDR44Q5JSH3 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
WDR44Q5JSH3 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
WDR44Q5JSH3 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
WDR44Q5JSH3 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
WDR44Q5JSH3 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
WDR44Q5JSH3 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
WDR44Q5JSH3 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
WDR44Q5JSH3 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
WDR44Q5JSH3 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
WDR44Q5JSH3 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
WDR44Q5JSH3 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
WDR44Q5JSH3 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
WDR44Q5JSH3 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
WDR44Q5JSH3 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
WDR44Q5JSH3 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
WDR44Q5JSH3 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
WDR44Q5JSH3 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
WDR44Q5JSH3 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
WDR44Q5JSH3 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
WDR44Q5JSH3 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
WDR44Q5JSH3 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
WDR44Q5JSH3 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
WDR44Q5JSH3 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
WDR44Q5JSH3 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
WDR44Q5JSH3 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
WDR44Q5JSH3 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
WDR44Q5JSH3 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
WDR44Q5JSH3 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
WDR44Q5JSH3 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
WDR44Q5JSH3 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
WDR44Q5JSH3 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
WDR44Q5JSH3 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
WDR44Q5JSH3 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
WDR44Q5JSH3 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
WDR44Q5JSH3 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
WDR44Q5JSH3 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
WDR44Q5JSH3 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
WDR44Q5JSH3 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
WDR44Q5JSH3 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
WDR44Q5JSH3 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
WDR44Q5JSH3 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
WDR44Q5JSH3 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
WDR44Q5JSH3 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
WDR44Q5JSH3 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
WDR44Q5JSH3 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
WDR44Q5JSH3 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
WDR44Q5JSH3 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
WDR44Q5JSH3 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
WDR44Q5JSH3 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
WDR44Q5JSH3 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
WDR44Q5JSH3 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.1 ms