Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJF6

ODF2, Outer dense fiber protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF2Q5BJF6 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ODF2Q5BJF6 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ODF2Q5BJF6 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ODF2Q5BJF6 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
ODF2Q5BJF6 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ODF2Q5BJF6 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ODF2Q5BJF6 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ODF2Q5BJF6 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ODF2Q5BJF6 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ODF2Q5BJF6 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ODF2Q5BJF6 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ODF2Q5BJF6 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
ODF2Q5BJF6 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ODF2Q5BJF6 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ODF2Q5BJF6 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ODF2Q5BJF6 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ODF2Q5BJF6 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ODF2Q5BJF6 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ODF2Q5BJF6 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ODF2Q5BJF6 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ODF2Q5BJF6 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ODF2Q5BJF6 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ODF2Q5BJF6 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ODF2Q5BJF6 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ODF2Q5BJF6 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ODF2Q5BJF6 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ODF2Q5BJF6 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ODF2Q5BJF6 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ODF2Q5BJF6 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ODF2Q5BJF6 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ODF2Q5BJF6 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ODF2Q5BJF6 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ODF2Q5BJF6 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ODF2Q5BJF6 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ODF2Q5BJF6 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ODF2Q5BJF6 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ODF2Q5BJF6 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ODF2Q5BJF6 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ODF2Q5BJF6 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ODF2Q5BJF6 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ODF2Q5BJF6 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ODF2Q5BJF6 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ODF2Q5BJF6 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ODF2Q5BJF6 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ODF2Q5BJF6 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ODF2Q5BJF6 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ODF2Q5BJF6 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ODF2Q5BJF6 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
ODF2Q5BJF6 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ODF2Q5BJF6 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ODF2Q5BJF6 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ODF2Q5BJF6 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ODF2Q5BJF6 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ODF2Q5BJF6 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ODF2Q5BJF6 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ODF2Q5BJF6 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ODF2Q5BJF6 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ODF2Q5BJF6 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ODF2Q5BJF6 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ODF2Q5BJF6 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ODF2Q5BJF6 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ODF2Q5BJF6 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ODF2Q5BJF6 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ODF2Q5BJF6 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ODF2Q5BJF6 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ODF2Q5BJF6 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ODF2Q5BJF6 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
ODF2Q5BJF6 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ODF2Q5BJF6 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ODF2Q5BJF6 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ODF2Q5BJF6 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ODF2Q5BJF6 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ODF2Q5BJF6 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ODF2Q5BJF6 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ODF2Q5BJF6 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ODF2Q5BJF6 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ODF2Q5BJF6 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ODF2Q5BJF6 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
ODF2Q5BJF6 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ODF2Q5BJF6 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ODF2Q5BJF6 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
ODF2Q5BJF6 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
ODF2Q5BJF6 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ODF2Q5BJF6 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ODF2Q5BJF6 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ODF2Q5BJF6 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ODF2Q5BJF6 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ODF2Q5BJF6 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
ODF2Q5BJF6 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ODF2Q5BJF6 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ODF2Q5BJF6 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ODF2Q5BJF6 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ODF2Q5BJF6 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
ODF2Q5BJF6 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ODF2Q5BJF6 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
ODF2Q5BJF6 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ODF2Q5BJF6 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ODF2Q5BJF6 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ODF2Q5BJF6 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ODF2Q5BJF6 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms