Protein–RNA interactions for Protein: Q587J7

TDRD12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD12Q587J7 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TDRD12Q587J7 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TDRD12Q587J7 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TDRD12Q587J7 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TDRD12Q587J7 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TDRD12Q587J7 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
TDRD12Q587J7 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TDRD12Q587J7 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TDRD12Q587J7 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TDRD12Q587J7 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TDRD12Q587J7 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TDRD12Q587J7 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TDRD12Q587J7 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TDRD12Q587J7 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
TDRD12Q587J7 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TDRD12Q587J7 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TDRD12Q587J7 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TDRD12Q587J7 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TDRD12Q587J7 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
TDRD12Q587J7 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TDRD12Q587J7 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TDRD12Q587J7 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
TDRD12Q587J7 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TDRD12Q587J7 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TDRD12Q587J7 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TDRD12Q587J7 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TDRD12Q587J7 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TDRD12Q587J7 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TDRD12Q587J7 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TDRD12Q587J7 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TDRD12Q587J7 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TDRD12Q587J7 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TDRD12Q587J7 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
TDRD12Q587J7 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TDRD12Q587J7 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TDRD12Q587J7 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TDRD12Q587J7 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TDRD12Q587J7 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
TDRD12Q587J7 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TDRD12Q587J7 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TDRD12Q587J7 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TDRD12Q587J7 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TDRD12Q587J7 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TDRD12Q587J7 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TDRD12Q587J7 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TDRD12Q587J7 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TDRD12Q587J7 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TDRD12Q587J7 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TDRD12Q587J7 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TDRD12Q587J7 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TDRD12Q587J7 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TDRD12Q587J7 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TDRD12Q587J7 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TDRD12Q587J7 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TDRD12Q587J7 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TDRD12Q587J7 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TDRD12Q587J7 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TDRD12Q587J7 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TDRD12Q587J7 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TDRD12Q587J7 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TDRD12Q587J7 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TDRD12Q587J7 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TDRD12Q587J7 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TDRD12Q587J7 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TDRD12Q587J7 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TDRD12Q587J7 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TDRD12Q587J7 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TDRD12Q587J7 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TDRD12Q587J7 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TDRD12Q587J7 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TDRD12Q587J7 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TDRD12Q587J7 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TDRD12Q587J7 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TDRD12Q587J7 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TDRD12Q587J7 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TDRD12Q587J7 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TDRD12Q587J7 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TDRD12Q587J7 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TDRD12Q587J7 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TDRD12Q587J7 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TDRD12Q587J7 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TDRD12Q587J7 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TDRD12Q587J7 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TDRD12Q587J7 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TDRD12Q587J7 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TDRD12Q587J7 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TDRD12Q587J7 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TDRD12Q587J7 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TDRD12Q587J7 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TDRD12Q587J7 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TDRD12Q587J7 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TDRD12Q587J7 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TDRD12Q587J7 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TDRD12Q587J7 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TDRD12Q587J7 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
TDRD12Q587J7 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
TDRD12Q587J7 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TDRD12Q587J7 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TDRD12Q587J7 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TDRD12Q587J7 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms