Protein–RNA interactions for Protein: Q53HL2

CDCA8, Borealin, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA8Q53HL2 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDCA8Q53HL2 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CDCA8Q53HL2 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDCA8Q53HL2 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CDCA8Q53HL2 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDCA8Q53HL2 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDCA8Q53HL2 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDCA8Q53HL2 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDCA8Q53HL2 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.35
CDCA8Q53HL2 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDCA8Q53HL2 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDCA8Q53HL2 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDCA8Q53HL2 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDCA8Q53HL2 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDCA8Q53HL2 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDCA8Q53HL2 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDCA8Q53HL2 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDCA8Q53HL2 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDCA8Q53HL2 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDCA8Q53HL2 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDCA8Q53HL2 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CDCA8Q53HL2 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDCA8Q53HL2 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDCA8Q53HL2 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDCA8Q53HL2 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDCA8Q53HL2 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDCA8Q53HL2 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDCA8Q53HL2 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDCA8Q53HL2 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDCA8Q53HL2 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDCA8Q53HL2 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CDCA8Q53HL2 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDCA8Q53HL2 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDCA8Q53HL2 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDCA8Q53HL2 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDCA8Q53HL2 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDCA8Q53HL2 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDCA8Q53HL2 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDCA8Q53HL2 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDCA8Q53HL2 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDCA8Q53HL2 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDCA8Q53HL2 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDCA8Q53HL2 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDCA8Q53HL2 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDCA8Q53HL2 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDCA8Q53HL2 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDCA8Q53HL2 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDCA8Q53HL2 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDCA8Q53HL2 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDCA8Q53HL2 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CDCA8Q53HL2 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CDCA8Q53HL2 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDCA8Q53HL2 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDCA8Q53HL2 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDCA8Q53HL2 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDCA8Q53HL2 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CDCA8Q53HL2 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CDCA8Q53HL2 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDCA8Q53HL2 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDCA8Q53HL2 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDCA8Q53HL2 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDCA8Q53HL2 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDCA8Q53HL2 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDCA8Q53HL2 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDCA8Q53HL2 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDCA8Q53HL2 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDCA8Q53HL2 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDCA8Q53HL2 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDCA8Q53HL2 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDCA8Q53HL2 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDCA8Q53HL2 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDCA8Q53HL2 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDCA8Q53HL2 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDCA8Q53HL2 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDCA8Q53HL2 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDCA8Q53HL2 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDCA8Q53HL2 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDCA8Q53HL2 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDCA8Q53HL2 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDCA8Q53HL2 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CDCA8Q53HL2 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDCA8Q53HL2 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDCA8Q53HL2 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDCA8Q53HL2 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDCA8Q53HL2 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CDCA8Q53HL2 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CDCA8Q53HL2 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDCA8Q53HL2 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDCA8Q53HL2 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDCA8Q53HL2 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDCA8Q53HL2 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDCA8Q53HL2 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDCA8Q53HL2 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CDCA8Q53HL2 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDCA8Q53HL2 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDCA8Q53HL2 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CDCA8Q53HL2 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDCA8Q53HL2 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDCA8Q53HL2 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDCA8Q53HL2 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms