Protein–RNA interactions for Protein: Q53GQ0

HSD17B12, Very-long-chain 3-oxoacyl-CoA reductase, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSD17B12Q53GQ0 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HSD17B12Q53GQ0 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HSD17B12Q53GQ0 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HSD17B12Q53GQ0 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HSD17B12Q53GQ0 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HSD17B12Q53GQ0 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HSD17B12Q53GQ0 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HSD17B12Q53GQ0 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HSD17B12Q53GQ0 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HSD17B12Q53GQ0 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HSD17B12Q53GQ0 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HSD17B12Q53GQ0 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HSD17B12Q53GQ0 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HSD17B12Q53GQ0 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HSD17B12Q53GQ0 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HSD17B12Q53GQ0 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HSD17B12Q53GQ0 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HSD17B12Q53GQ0 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HSD17B12Q53GQ0 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HSD17B12Q53GQ0 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HSD17B12Q53GQ0 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HSD17B12Q53GQ0 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HSD17B12Q53GQ0 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HSD17B12Q53GQ0 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HSD17B12Q53GQ0 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HSD17B12Q53GQ0 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HSD17B12Q53GQ0 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
HSD17B12Q53GQ0 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HSD17B12Q53GQ0 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HSD17B12Q53GQ0 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HSD17B12Q53GQ0 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HSD17B12Q53GQ0 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HSD17B12Q53GQ0 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HSD17B12Q53GQ0 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HSD17B12Q53GQ0 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HSD17B12Q53GQ0 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HSD17B12Q53GQ0 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HSD17B12Q53GQ0 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HSD17B12Q53GQ0 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HSD17B12Q53GQ0 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HSD17B12Q53GQ0 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HSD17B12Q53GQ0 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HSD17B12Q53GQ0 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HSD17B12Q53GQ0 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HSD17B12Q53GQ0 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HSD17B12Q53GQ0 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HSD17B12Q53GQ0 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HSD17B12Q53GQ0 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HSD17B12Q53GQ0 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
HSD17B12Q53GQ0 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HSD17B12Q53GQ0 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HSD17B12Q53GQ0 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HSD17B12Q53GQ0 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HSD17B12Q53GQ0 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HSD17B12Q53GQ0 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HSD17B12Q53GQ0 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HSD17B12Q53GQ0 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HSD17B12Q53GQ0 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HSD17B12Q53GQ0 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HSD17B12Q53GQ0 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HSD17B12Q53GQ0 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HSD17B12Q53GQ0 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HSD17B12Q53GQ0 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HSD17B12Q53GQ0 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
HSD17B12Q53GQ0 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HSD17B12Q53GQ0 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HSD17B12Q53GQ0 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HSD17B12Q53GQ0 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HSD17B12Q53GQ0 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HSD17B12Q53GQ0 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HSD17B12Q53GQ0 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HSD17B12Q53GQ0 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
HSD17B12Q53GQ0 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HSD17B12Q53GQ0 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HSD17B12Q53GQ0 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HSD17B12Q53GQ0 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HSD17B12Q53GQ0 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HSD17B12Q53GQ0 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HSD17B12Q53GQ0 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
HSD17B12Q53GQ0 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
HSD17B12Q53GQ0 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
HSD17B12Q53GQ0 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
HSD17B12Q53GQ0 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HSD17B12Q53GQ0 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HSD17B12Q53GQ0 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HSD17B12Q53GQ0 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HSD17B12Q53GQ0 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HSD17B12Q53GQ0 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
HSD17B12Q53GQ0 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HSD17B12Q53GQ0 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HSD17B12Q53GQ0 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HSD17B12Q53GQ0 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HSD17B12Q53GQ0 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HSD17B12Q53GQ0 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HSD17B12Q53GQ0 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HSD17B12Q53GQ0 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HSD17B12Q53GQ0 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HSD17B12Q53GQ0 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HSD17B12Q53GQ0 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HSD17B12Q53GQ0 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms