Protein–RNA interactions for Protein: Q502W7

CCDC38, Coiled-coil domain-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC38Q502W7 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC38Q502W7 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC38Q502W7 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC38Q502W7 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC38Q502W7 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC38Q502W7 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC38Q502W7 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC38Q502W7 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC38Q502W7 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC38Q502W7 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC38Q502W7 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC38Q502W7 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC38Q502W7 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC38Q502W7 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC38Q502W7 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC38Q502W7 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC38Q502W7 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC38Q502W7 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC38Q502W7 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC38Q502W7 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC38Q502W7 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC38Q502W7 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC38Q502W7 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC38Q502W7 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC38Q502W7 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC38Q502W7 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC38Q502W7 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC38Q502W7 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC38Q502W7 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC38Q502W7 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC38Q502W7 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC38Q502W7 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC38Q502W7 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC38Q502W7 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC38Q502W7 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC38Q502W7 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC38Q502W7 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC38Q502W7 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC38Q502W7 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC38Q502W7 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC38Q502W7 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC38Q502W7 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC38Q502W7 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC38Q502W7 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC38Q502W7 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC38Q502W7 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC38Q502W7 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC38Q502W7 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC38Q502W7 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC38Q502W7 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC38Q502W7 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC38Q502W7 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC38Q502W7 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC38Q502W7 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC38Q502W7 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC38Q502W7 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC38Q502W7 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC38Q502W7 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC38Q502W7 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC38Q502W7 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC38Q502W7 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC38Q502W7 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC38Q502W7 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC38Q502W7 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC38Q502W7 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC38Q502W7 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC38Q502W7 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC38Q502W7 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC38Q502W7 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC38Q502W7 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC38Q502W7 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC38Q502W7 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC38Q502W7 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC38Q502W7 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC38Q502W7 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC38Q502W7 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC38Q502W7 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC38Q502W7 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC38Q502W7 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC38Q502W7 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC38Q502W7 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC38Q502W7 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC38Q502W7 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC38Q502W7 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC38Q502W7 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC38Q502W7 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC38Q502W7 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC38Q502W7 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC38Q502W7 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC38Q502W7 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC38Q502W7 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC38Q502W7 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC38Q502W7 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC38Q502W7 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC38Q502W7 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC38Q502W7 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC38Q502W7 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC38Q502W7 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC38Q502W7 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC38Q502W7 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms