Protein–RNA interactions for Protein: Q4VC31

CCDC58, Coiled-coil domain-containing protein 58, humanhuman

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC58Q4VC31 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC58Q4VC31 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC58Q4VC31 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC58Q4VC31 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC58Q4VC31 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC58Q4VC31 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC58Q4VC31 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC58Q4VC31 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC58Q4VC31 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC58Q4VC31 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC58Q4VC31 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC58Q4VC31 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC58Q4VC31 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC58Q4VC31 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC58Q4VC31 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC58Q4VC31 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC58Q4VC31 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC58Q4VC31 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC58Q4VC31 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC58Q4VC31 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC58Q4VC31 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC58Q4VC31 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC58Q4VC31 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC58Q4VC31 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC58Q4VC31 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC58Q4VC31 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC58Q4VC31 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC58Q4VC31 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC58Q4VC31 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC58Q4VC31 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC58Q4VC31 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC58Q4VC31 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC58Q4VC31 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC58Q4VC31 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC58Q4VC31 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC58Q4VC31 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC58Q4VC31 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC58Q4VC31 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC58Q4VC31 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC58Q4VC31 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC58Q4VC31 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC58Q4VC31 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC58Q4VC31 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC58Q4VC31 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC58Q4VC31 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC58Q4VC31 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC58Q4VC31 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC58Q4VC31 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC58Q4VC31 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC58Q4VC31 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC58Q4VC31 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC58Q4VC31 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC58Q4VC31 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC58Q4VC31 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC58Q4VC31 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC58Q4VC31 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC58Q4VC31 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC58Q4VC31 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC58Q4VC31 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC58Q4VC31 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC58Q4VC31 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC58Q4VC31 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC58Q4VC31 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC58Q4VC31 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC58Q4VC31 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC58Q4VC31 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC58Q4VC31 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC58Q4VC31 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC58Q4VC31 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC58Q4VC31 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC58Q4VC31 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC58Q4VC31 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC58Q4VC31 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC58Q4VC31 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC58Q4VC31 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC58Q4VC31 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC58Q4VC31 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC58Q4VC31 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC58Q4VC31 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC58Q4VC31 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC58Q4VC31 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC58Q4VC31 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC58Q4VC31 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC58Q4VC31 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC58Q4VC31 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC58Q4VC31 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC58Q4VC31 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC58Q4VC31 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC58Q4VC31 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC58Q4VC31 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC58Q4VC31 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC58Q4VC31 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC58Q4VC31 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC58Q4VC31 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC58Q4VC31 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC58Q4VC31 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC58Q4VC31 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC58Q4VC31 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC58Q4VC31 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC58Q4VC31 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms