Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDR2

CTXN3, Cortexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3Q4LDR2 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTXN3Q4LDR2 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTXN3Q4LDR2 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTXN3Q4LDR2 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTXN3Q4LDR2 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTXN3Q4LDR2 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTXN3Q4LDR2 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTXN3Q4LDR2 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTXN3Q4LDR2 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTXN3Q4LDR2 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTXN3Q4LDR2 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTXN3Q4LDR2 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTXN3Q4LDR2 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTXN3Q4LDR2 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTXN3Q4LDR2 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTXN3Q4LDR2 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTXN3Q4LDR2 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTXN3Q4LDR2 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTXN3Q4LDR2 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTXN3Q4LDR2 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTXN3Q4LDR2 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTXN3Q4LDR2 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CTXN3Q4LDR2 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTXN3Q4LDR2 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CTXN3Q4LDR2 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTXN3Q4LDR2 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTXN3Q4LDR2 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTXN3Q4LDR2 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTXN3Q4LDR2 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTXN3Q4LDR2 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTXN3Q4LDR2 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTXN3Q4LDR2 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTXN3Q4LDR2 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTXN3Q4LDR2 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTXN3Q4LDR2 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTXN3Q4LDR2 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTXN3Q4LDR2 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTXN3Q4LDR2 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CTXN3Q4LDR2 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTXN3Q4LDR2 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTXN3Q4LDR2 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTXN3Q4LDR2 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTXN3Q4LDR2 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTXN3Q4LDR2 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTXN3Q4LDR2 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTXN3Q4LDR2 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTXN3Q4LDR2 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTXN3Q4LDR2 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTXN3Q4LDR2 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTXN3Q4LDR2 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTXN3Q4LDR2 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTXN3Q4LDR2 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTXN3Q4LDR2 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTXN3Q4LDR2 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTXN3Q4LDR2 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTXN3Q4LDR2 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTXN3Q4LDR2 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTXN3Q4LDR2 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CTXN3Q4LDR2 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTXN3Q4LDR2 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTXN3Q4LDR2 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTXN3Q4LDR2 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CTXN3Q4LDR2 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CTXN3Q4LDR2 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTXN3Q4LDR2 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CTXN3Q4LDR2 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CTXN3Q4LDR2 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTXN3Q4LDR2 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTXN3Q4LDR2 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTXN3Q4LDR2 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTXN3Q4LDR2 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTXN3Q4LDR2 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTXN3Q4LDR2 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTXN3Q4LDR2 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTXN3Q4LDR2 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTXN3Q4LDR2 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTXN3Q4LDR2 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTXN3Q4LDR2 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTXN3Q4LDR2 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTXN3Q4LDR2 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTXN3Q4LDR2 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTXN3Q4LDR2 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTXN3Q4LDR2 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTXN3Q4LDR2 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTXN3Q4LDR2 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTXN3Q4LDR2 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTXN3Q4LDR2 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTXN3Q4LDR2 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTXN3Q4LDR2 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTXN3Q4LDR2 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTXN3Q4LDR2 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTXN3Q4LDR2 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTXN3Q4LDR2 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTXN3Q4LDR2 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTXN3Q4LDR2 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTXN3Q4LDR2 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTXN3Q4LDR2 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTXN3Q4LDR2 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTXN3Q4LDR2 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTXN3Q4LDR2 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms