Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY05

LINC00303, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00303, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00303Q3SY05 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
LINC00303Q3SY05 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LINC00303Q3SY05 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
LINC00303Q3SY05 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LINC00303Q3SY05 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00303Q3SY05 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00303Q3SY05 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00303Q3SY05 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00303Q3SY05 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00303Q3SY05 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00303Q3SY05 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00303Q3SY05 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00303Q3SY05 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00303Q3SY05 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00303Q3SY05 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00303Q3SY05 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00303Q3SY05 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00303Q3SY05 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00303Q3SY05 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00303Q3SY05 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00303Q3SY05 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00303Q3SY05 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00303Q3SY05 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00303Q3SY05 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00303Q3SY05 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00303Q3SY05 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00303Q3SY05 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00303Q3SY05 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00303Q3SY05 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00303Q3SY05 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00303Q3SY05 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00303Q3SY05 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00303Q3SY05 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00303Q3SY05 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00303Q3SY05 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00303Q3SY05 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00303Q3SY05 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00303Q3SY05 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00303Q3SY05 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00303Q3SY05 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00303Q3SY05 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00303Q3SY05 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00303Q3SY05 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00303Q3SY05 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00303Q3SY05 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00303Q3SY05 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00303Q3SY05 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00303Q3SY05 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00303Q3SY05 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00303Q3SY05 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00303Q3SY05 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00303Q3SY05 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00303Q3SY05 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00303Q3SY05 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00303Q3SY05 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00303Q3SY05 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00303Q3SY05 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00303Q3SY05 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00303Q3SY05 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00303Q3SY05 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00303Q3SY05 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00303Q3SY05 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00303Q3SY05 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00303Q3SY05 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00303Q3SY05 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00303Q3SY05 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00303Q3SY05 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00303Q3SY05 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00303Q3SY05 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00303Q3SY05 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00303Q3SY05 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00303Q3SY05 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00303Q3SY05 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00303Q3SY05 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00303Q3SY05 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00303Q3SY05 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00303Q3SY05 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00303Q3SY05 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00303Q3SY05 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00303Q3SY05 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00303Q3SY05 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00303Q3SY05 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00303Q3SY05 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00303Q3SY05 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00303Q3SY05 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00303Q3SY05 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00303Q3SY05 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00303Q3SY05 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00303Q3SY05 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00303Q3SY05 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00303Q3SY05 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00303Q3SY05 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00303Q3SY05 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00303Q3SY05 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00303Q3SY05 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00303Q3SY05 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00303Q3SY05 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00303Q3SY05 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00303Q3SY05 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00303Q3SY05 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms