Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXZ7

TTLL9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL9Q3SXZ7 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
TTLL9Q3SXZ7 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TTLL9Q3SXZ7 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TTLL9Q3SXZ7 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TTLL9Q3SXZ7 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TTLL9Q3SXZ7 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TTLL9Q3SXZ7 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TTLL9Q3SXZ7 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TTLL9Q3SXZ7 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TTLL9Q3SXZ7 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TTLL9Q3SXZ7 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TTLL9Q3SXZ7 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
TTLL9Q3SXZ7 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TTLL9Q3SXZ7 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TTLL9Q3SXZ7 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TTLL9Q3SXZ7 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TTLL9Q3SXZ7 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TTLL9Q3SXZ7 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TTLL9Q3SXZ7 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TTLL9Q3SXZ7 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TTLL9Q3SXZ7 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TTLL9Q3SXZ7 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TTLL9Q3SXZ7 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TTLL9Q3SXZ7 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TTLL9Q3SXZ7 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TTLL9Q3SXZ7 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TTLL9Q3SXZ7 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TTLL9Q3SXZ7 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TTLL9Q3SXZ7 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TTLL9Q3SXZ7 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TTLL9Q3SXZ7 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TTLL9Q3SXZ7 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TTLL9Q3SXZ7 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
TTLL9Q3SXZ7 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TTLL9Q3SXZ7 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TTLL9Q3SXZ7 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TTLL9Q3SXZ7 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TTLL9Q3SXZ7 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TTLL9Q3SXZ7 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
TTLL9Q3SXZ7 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TTLL9Q3SXZ7 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TTLL9Q3SXZ7 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
TTLL9Q3SXZ7 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
TTLL9Q3SXZ7 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TTLL9Q3SXZ7 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TTLL9Q3SXZ7 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TTLL9Q3SXZ7 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
TTLL9Q3SXZ7 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TTLL9Q3SXZ7 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
TTLL9Q3SXZ7 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TTLL9Q3SXZ7 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TTLL9Q3SXZ7 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TTLL9Q3SXZ7 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TTLL9Q3SXZ7 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TTLL9Q3SXZ7 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TTLL9Q3SXZ7 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TTLL9Q3SXZ7 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TTLL9Q3SXZ7 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TTLL9Q3SXZ7 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TTLL9Q3SXZ7 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TTLL9Q3SXZ7 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TTLL9Q3SXZ7 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TTLL9Q3SXZ7 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TTLL9Q3SXZ7 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TTLL9Q3SXZ7 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TTLL9Q3SXZ7 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TTLL9Q3SXZ7 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TTLL9Q3SXZ7 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TTLL9Q3SXZ7 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TTLL9Q3SXZ7 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TTLL9Q3SXZ7 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TTLL9Q3SXZ7 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TTLL9Q3SXZ7 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TTLL9Q3SXZ7 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TTLL9Q3SXZ7 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TTLL9Q3SXZ7 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TTLL9Q3SXZ7 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TTLL9Q3SXZ7 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TTLL9Q3SXZ7 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TTLL9Q3SXZ7 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
TTLL9Q3SXZ7 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TTLL9Q3SXZ7 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TTLL9Q3SXZ7 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TTLL9Q3SXZ7 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TTLL9Q3SXZ7 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TTLL9Q3SXZ7 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TTLL9Q3SXZ7 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TTLL9Q3SXZ7 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TTLL9Q3SXZ7 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TTLL9Q3SXZ7 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TTLL9Q3SXZ7 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TTLL9Q3SXZ7 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TTLL9Q3SXZ7 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
TTLL9Q3SXZ7 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TTLL9Q3SXZ7 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
TTLL9Q3SXZ7 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
TTLL9Q3SXZ7 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
TTLL9Q3SXZ7 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
TTLL9Q3SXZ7 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TTLL9Q3SXZ7 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms