Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
RTL8BQ17RB0 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
RTL8BQ17RB0 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
RTL8BQ17RB0 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
RTL8BQ17RB0 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
RTL8BQ17RB0 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
RTL8BQ17RB0 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
RTL8BQ17RB0 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
RTL8BQ17RB0 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
RTL8BQ17RB0 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
RTL8BQ17RB0 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
RTL8BQ17RB0 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
RTL8BQ17RB0 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
RTL8BQ17RB0 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
RTL8BQ17RB0 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC14.03□□□□□ -0.16
RTL8BQ17RB0 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
RTL8BQ17RB0 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
RTL8BQ17RB0 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
RTL8BQ17RB0 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
RTL8BQ17RB0 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
RTL8BQ17RB0 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
RTL8BQ17RB0 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC14.03□□□□□ -0.16
RTL8BQ17RB0 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
RTL8BQ17RB0 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
RTL8BQ17RB0 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
RTL8BQ17RB0 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
RTL8BQ17RB0 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
RTL8BQ17RB0 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
RTL8BQ17RB0 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
RTL8BQ17RB0 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
RTL8BQ17RB0 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
RTL8BQ17RB0 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
RTL8BQ17RB0 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC14.02□□□□□ -0.16
RTL8BQ17RB0 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
RTL8BQ17RB0 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
RTL8BQ17RB0 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
RTL8BQ17RB0 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
RTL8BQ17RB0 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
RTL8BQ17RB0 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
RTL8BQ17RB0 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
RTL8BQ17RB0 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
RTL8BQ17RB0 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
RTL8BQ17RB0 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
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RTL8BQ17RB0 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
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RTL8BQ17RB0 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
RTL8BQ17RB0 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
RTL8BQ17RB0 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
RTL8BQ17RB0 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC14.02□□□□□ -0.17
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RTL8BQ17RB0 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
RTL8BQ17RB0 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
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RTL8BQ17RB0 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
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RTL8BQ17RB0 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
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RTL8BQ17RB0 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
RTL8BQ17RB0 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
RTL8BQ17RB0 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
RTL8BQ17RB0 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
RTL8BQ17RB0 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
RTL8BQ17RB0 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
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