Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

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Length 826 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HIF1AQ16665 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HIF1AQ16665 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HIF1AQ16665 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HIF1AQ16665 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HIF1AQ16665 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HIF1AQ16665 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HIF1AQ16665 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HIF1AQ16665 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HIF1AQ16665 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HIF1AQ16665 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HIF1AQ16665 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HIF1AQ16665 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HIF1AQ16665 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HIF1AQ16665 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HIF1AQ16665 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HIF1AQ16665 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HIF1AQ16665 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HIF1AQ16665 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HIF1AQ16665 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HIF1AQ16665 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HIF1AQ16665 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
HIF1AQ16665 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HIF1AQ16665 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HIF1AQ16665 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
HIF1AQ16665 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HIF1AQ16665 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HIF1AQ16665 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HIF1AQ16665 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HIF1AQ16665 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
HIF1AQ16665 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
HIF1AQ16665 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HIF1AQ16665 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HIF1AQ16665 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HIF1AQ16665 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HIF1AQ16665 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
HIF1AQ16665 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HIF1AQ16665 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HIF1AQ16665 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HIF1AQ16665 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HIF1AQ16665 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HIF1AQ16665 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HIF1AQ16665 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HIF1AQ16665 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HIF1AQ16665 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HIF1AQ16665 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HIF1AQ16665 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HIF1AQ16665 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HIF1AQ16665 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HIF1AQ16665 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HIF1AQ16665 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HIF1AQ16665 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HIF1AQ16665 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HIF1AQ16665 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HIF1AQ16665 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HIF1AQ16665 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HIF1AQ16665 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HIF1AQ16665 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HIF1AQ16665 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HIF1AQ16665 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HIF1AQ16665 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HIF1AQ16665 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HIF1AQ16665 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HIF1AQ16665 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HIF1AQ16665 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HIF1AQ16665 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HIF1AQ16665 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HIF1AQ16665 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
HIF1AQ16665 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HIF1AQ16665 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HIF1AQ16665 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HIF1AQ16665 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HIF1AQ16665 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HIF1AQ16665 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HIF1AQ16665 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
HIF1AQ16665 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HIF1AQ16665 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HIF1AQ16665 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HIF1AQ16665 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HIF1AQ16665 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HIF1AQ16665 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HIF1AQ16665 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HIF1AQ16665 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HIF1AQ16665 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HIF1AQ16665 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HIF1AQ16665 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HIF1AQ16665 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HIF1AQ16665 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HIF1AQ16665 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HIF1AQ16665 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HIF1AQ16665 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HIF1AQ16665 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HIF1AQ16665 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HIF1AQ16665 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HIF1AQ16665 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HIF1AQ16665 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HIF1AQ16665 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HIF1AQ16665 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HIF1AQ16665 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HIF1AQ16665 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
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