Protein–RNA interactions for Protein: Q16527

CSRP2, Cysteine and glycine-rich protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRP2Q16527 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CSRP2Q16527 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CSRP2Q16527 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CSRP2Q16527 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CSRP2Q16527 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CSRP2Q16527 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CSRP2Q16527 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CSRP2Q16527 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CSRP2Q16527 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CSRP2Q16527 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CSRP2Q16527 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CSRP2Q16527 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CSRP2Q16527 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CSRP2Q16527 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CSRP2Q16527 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CSRP2Q16527 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CSRP2Q16527 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CSRP2Q16527 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CSRP2Q16527 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CSRP2Q16527 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CSRP2Q16527 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CSRP2Q16527 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CSRP2Q16527 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CSRP2Q16527 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CSRP2Q16527 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CSRP2Q16527 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CSRP2Q16527 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CSRP2Q16527 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CSRP2Q16527 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CSRP2Q16527 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CSRP2Q16527 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CSRP2Q16527 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CSRP2Q16527 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CSRP2Q16527 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CSRP2Q16527 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CSRP2Q16527 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CSRP2Q16527 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CSRP2Q16527 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CSRP2Q16527 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CSRP2Q16527 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CSRP2Q16527 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CSRP2Q16527 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CSRP2Q16527 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CSRP2Q16527 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CSRP2Q16527 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CSRP2Q16527 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CSRP2Q16527 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CSRP2Q16527 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CSRP2Q16527 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CSRP2Q16527 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CSRP2Q16527 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CSRP2Q16527 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CSRP2Q16527 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CSRP2Q16527 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CSRP2Q16527 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CSRP2Q16527 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CSRP2Q16527 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CSRP2Q16527 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CSRP2Q16527 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CSRP2Q16527 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CSRP2Q16527 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CSRP2Q16527 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CSRP2Q16527 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CSRP2Q16527 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CSRP2Q16527 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CSRP2Q16527 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CSRP2Q16527 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CSRP2Q16527 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CSRP2Q16527 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CSRP2Q16527 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CSRP2Q16527 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CSRP2Q16527 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CSRP2Q16527 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CSRP2Q16527 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CSRP2Q16527 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CSRP2Q16527 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CSRP2Q16527 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CSRP2Q16527 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CSRP2Q16527 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CSRP2Q16527 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CSRP2Q16527 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CSRP2Q16527 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CSRP2Q16527 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CSRP2Q16527 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CSRP2Q16527 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CSRP2Q16527 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CSRP2Q16527 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CSRP2Q16527 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CSRP2Q16527 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CSRP2Q16527 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CSRP2Q16527 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CSRP2Q16527 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CSRP2Q16527 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CSRP2Q16527 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CSRP2Q16527 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CSRP2Q16527 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CSRP2Q16527 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CSRP2Q16527 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CSRP2Q16527 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CSRP2Q16527 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms