Protein–RNA interactions for Protein: Q16378

PRR4, Proline-rich protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRR4Q16378 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PRR4Q16378 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
PRR4Q16378 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PRR4Q16378 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PRR4Q16378 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PRR4Q16378 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PRR4Q16378 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PRR4Q16378 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
PRR4Q16378 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
PRR4Q16378 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PRR4Q16378 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
PRR4Q16378 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PRR4Q16378 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PRR4Q16378 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PRR4Q16378 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PRR4Q16378 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PRR4Q16378 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
PRR4Q16378 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
PRR4Q16378 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
PRR4Q16378 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC10.58□□□□□ -0.72
PRR4Q16378 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
PRR4Q16378 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PRR4Q16378 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
PRR4Q16378 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
PRR4Q16378 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
PRR4Q16378 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
PRR4Q16378 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
PRR4Q16378 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
PRR4Q16378 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PRR4Q16378 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PRR4Q16378 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
PRR4Q16378 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PRR4Q16378 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PRR4Q16378 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
PRR4Q16378 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PRR4Q16378 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PRR4Q16378 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PRR4Q16378 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
PRR4Q16378 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
PRR4Q16378 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
PRR4Q16378 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PRR4Q16378 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PRR4Q16378 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
PRR4Q16378 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PRR4Q16378 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PRR4Q16378 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PRR4Q16378 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
PRR4Q16378 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PRR4Q16378 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PRR4Q16378 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
PRR4Q16378 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
PRR4Q16378 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
PRR4Q16378 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PRR4Q16378 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
PRR4Q16378 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
PRR4Q16378 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PRR4Q16378 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PRR4Q16378 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
PRR4Q16378 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
PRR4Q16378 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
PRR4Q16378 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PRR4Q16378 MGRN1-203ENST00000415496 6405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PRR4Q16378 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
PRR4Q16378 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
PRR4Q16378 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
PRR4Q16378 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PRR4Q16378 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
PRR4Q16378 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
PRR4Q16378 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PRR4Q16378 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
PRR4Q16378 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PRR4Q16378 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
PRR4Q16378 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PRR4Q16378 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
PRR4Q16378 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
PRR4Q16378 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
PRR4Q16378 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
PRR4Q16378 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
PRR4Q16378 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
PRR4Q16378 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
PRR4Q16378 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PRR4Q16378 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
PRR4Q16378 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
PRR4Q16378 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PRR4Q16378 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PRR4Q16378 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
PRR4Q16378 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
PRR4Q16378 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
PRR4Q16378 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
PRR4Q16378 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
PRR4Q16378 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
PRR4Q16378 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PRR4Q16378 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
PRR4Q16378 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PRR4Q16378 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
PRR4Q16378 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
PRR4Q16378 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PRR4Q16378 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PRR4Q16378 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PRR4Q16378 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.3 ms