Protein–RNA interactions for Protein: Q15050

RRS1, Ribosome biogenesis regulatory protein homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 365 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRS1Q15050 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RRS1Q15050 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RRS1Q15050 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RRS1Q15050 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RRS1Q15050 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RRS1Q15050 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RRS1Q15050 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RRS1Q15050 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RRS1Q15050 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RRS1Q15050 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RRS1Q15050 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RRS1Q15050 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RRS1Q15050 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RRS1Q15050 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RRS1Q15050 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RRS1Q15050 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RRS1Q15050 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RRS1Q15050 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RRS1Q15050 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RRS1Q15050 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RRS1Q15050 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RRS1Q15050 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RRS1Q15050 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RRS1Q15050 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RRS1Q15050 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RRS1Q15050 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RRS1Q15050 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RRS1Q15050 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RRS1Q15050 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RRS1Q15050 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RRS1Q15050 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RRS1Q15050 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RRS1Q15050 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RRS1Q15050 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RRS1Q15050 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RRS1Q15050 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RRS1Q15050 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RRS1Q15050 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RRS1Q15050 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RRS1Q15050 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RRS1Q15050 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RRS1Q15050 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RRS1Q15050 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RRS1Q15050 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RRS1Q15050 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
RRS1Q15050 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
RRS1Q15050 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RRS1Q15050 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
RRS1Q15050 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RRS1Q15050 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RRS1Q15050 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RRS1Q15050 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RRS1Q15050 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
RRS1Q15050 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RRS1Q15050 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RRS1Q15050 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RRS1Q15050 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RRS1Q15050 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RRS1Q15050 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RRS1Q15050 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RRS1Q15050 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RRS1Q15050 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RRS1Q15050 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RRS1Q15050 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RRS1Q15050 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RRS1Q15050 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RRS1Q15050 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
RRS1Q15050 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RRS1Q15050 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RRS1Q15050 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
RRS1Q15050 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RRS1Q15050 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RRS1Q15050 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
RRS1Q15050 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
RRS1Q15050 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RRS1Q15050 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RRS1Q15050 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RRS1Q15050 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RRS1Q15050 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RRS1Q15050 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RRS1Q15050 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RRS1Q15050 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RRS1Q15050 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RRS1Q15050 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RRS1Q15050 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RRS1Q15050 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RRS1Q15050 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RRS1Q15050 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RRS1Q15050 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RRS1Q15050 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RRS1Q15050 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RRS1Q15050 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RRS1Q15050 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RRS1Q15050 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RRS1Q15050 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RRS1Q15050 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RRS1Q15050 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RRS1Q15050 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RRS1Q15050 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RRS1Q15050 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
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