Protein–RNA interactions for Protein: Q14993

COL19A1, Collagen alpha-1(XIX) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL19A1Q14993 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
COL19A1Q14993 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
COL19A1Q14993 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
COL19A1Q14993 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
COL19A1Q14993 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
COL19A1Q14993 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
COL19A1Q14993 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
COL19A1Q14993 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
COL19A1Q14993 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
COL19A1Q14993 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
COL19A1Q14993 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
COL19A1Q14993 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
COL19A1Q14993 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
COL19A1Q14993 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
COL19A1Q14993 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
COL19A1Q14993 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
COL19A1Q14993 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
COL19A1Q14993 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
COL19A1Q14993 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
COL19A1Q14993 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
COL19A1Q14993 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
COL19A1Q14993 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
COL19A1Q14993 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
COL19A1Q14993 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
COL19A1Q14993 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
COL19A1Q14993 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
COL19A1Q14993 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
COL19A1Q14993 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
COL19A1Q14993 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
COL19A1Q14993 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
COL19A1Q14993 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
COL19A1Q14993 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
COL19A1Q14993 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
COL19A1Q14993 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
COL19A1Q14993 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
COL19A1Q14993 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
COL19A1Q14993 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
COL19A1Q14993 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
COL19A1Q14993 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
COL19A1Q14993 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
COL19A1Q14993 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
COL19A1Q14993 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
COL19A1Q14993 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
COL19A1Q14993 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
COL19A1Q14993 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
COL19A1Q14993 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
COL19A1Q14993 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
COL19A1Q14993 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
COL19A1Q14993 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
COL19A1Q14993 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
COL19A1Q14993 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
COL19A1Q14993 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
COL19A1Q14993 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
COL19A1Q14993 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
COL19A1Q14993 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
COL19A1Q14993 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
COL19A1Q14993 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
COL19A1Q14993 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
COL19A1Q14993 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
COL19A1Q14993 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
COL19A1Q14993 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
COL19A1Q14993 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
COL19A1Q14993 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
COL19A1Q14993 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
COL19A1Q14993 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
COL19A1Q14993 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
COL19A1Q14993 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
COL19A1Q14993 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
COL19A1Q14993 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
COL19A1Q14993 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
COL19A1Q14993 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
COL19A1Q14993 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
COL19A1Q14993 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
COL19A1Q14993 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
COL19A1Q14993 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
COL19A1Q14993 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
COL19A1Q14993 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
COL19A1Q14993 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
COL19A1Q14993 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
COL19A1Q14993 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
COL19A1Q14993 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
COL19A1Q14993 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
COL19A1Q14993 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
COL19A1Q14993 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
COL19A1Q14993 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
COL19A1Q14993 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
COL19A1Q14993 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
COL19A1Q14993 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
COL19A1Q14993 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
COL19A1Q14993 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
COL19A1Q14993 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
COL19A1Q14993 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
COL19A1Q14993 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
COL19A1Q14993 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
COL19A1Q14993 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
COL19A1Q14993 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
COL19A1Q14993 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
COL19A1Q14993 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
COL19A1Q14993 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
COL19A1Q14993 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms