Protein–RNA interactions for Protein: Q14541

HNF4G, Hepatocyte nuclear factor 4-gamma, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNF4GQ14541 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
HNF4GQ14541 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
HNF4GQ14541 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
HNF4GQ14541 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
HNF4GQ14541 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
HNF4GQ14541 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
HNF4GQ14541 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
HNF4GQ14541 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
HNF4GQ14541 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
HNF4GQ14541 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
HNF4GQ14541 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
HNF4GQ14541 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
HNF4GQ14541 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
HNF4GQ14541 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
HNF4GQ14541 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
HNF4GQ14541 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
HNF4GQ14541 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
HNF4GQ14541 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
HNF4GQ14541 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
HNF4GQ14541 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
HNF4GQ14541 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
HNF4GQ14541 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
HNF4GQ14541 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
HNF4GQ14541 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
HNF4GQ14541 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
HNF4GQ14541 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
HNF4GQ14541 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
HNF4GQ14541 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
HNF4GQ14541 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
HNF4GQ14541 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
HNF4GQ14541 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
HNF4GQ14541 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
HNF4GQ14541 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
HNF4GQ14541 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
HNF4GQ14541 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
HNF4GQ14541 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
HNF4GQ14541 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
HNF4GQ14541 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
HNF4GQ14541 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
HNF4GQ14541 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
HNF4GQ14541 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
HNF4GQ14541 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
HNF4GQ14541 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
HNF4GQ14541 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
HNF4GQ14541 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
HNF4GQ14541 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
HNF4GQ14541 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
HNF4GQ14541 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
HNF4GQ14541 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
HNF4GQ14541 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
HNF4GQ14541 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
HNF4GQ14541 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
HNF4GQ14541 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
HNF4GQ14541 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
HNF4GQ14541 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
HNF4GQ14541 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
HNF4GQ14541 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
HNF4GQ14541 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
HNF4GQ14541 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
HNF4GQ14541 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
HNF4GQ14541 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
HNF4GQ14541 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
HNF4GQ14541 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
HNF4GQ14541 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
HNF4GQ14541 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
HNF4GQ14541 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
HNF4GQ14541 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
HNF4GQ14541 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
HNF4GQ14541 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
HNF4GQ14541 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
HNF4GQ14541 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC14.37□□□□□ -0.11
HNF4GQ14541 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
HNF4GQ14541 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
HNF4GQ14541 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
HNF4GQ14541 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
HNF4GQ14541 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
HNF4GQ14541 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
HNF4GQ14541 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
HNF4GQ14541 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
HNF4GQ14541 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
HNF4GQ14541 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
HNF4GQ14541 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
HNF4GQ14541 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
HNF4GQ14541 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
HNF4GQ14541 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
HNF4GQ14541 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
HNF4GQ14541 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
HNF4GQ14541 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
HNF4GQ14541 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
HNF4GQ14541 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
HNF4GQ14541 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
HNF4GQ14541 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
HNF4GQ14541 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
HNF4GQ14541 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
HNF4GQ14541 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
HNF4GQ14541 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
HNF4GQ14541 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
HNF4GQ14541 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
HNF4GQ14541 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
HNF4GQ14541 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
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